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目的
明确参与甲型流感病毒(IAV)感染小鼠肺组织中环状RNA (circRNA)的表达变化,并分析其靶基因生物学功能。
方法采用高通量测序的方法,测定并鉴定了IAV感染组和正常对照组小鼠肺组织中circRNA的表达差异及其靶基因。利用Gene Ontology (GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG )软件分析差异表达的circRNA靶基因生物学功能。
结果共获得12个显著差异表达的circRNAs(差异倍数> 2),其中circRNA5828表达量显著下调,circRNA13602和circRNA13853表达量显著上调。生物信息学软件分析表明,12个circRNA靶基因在生物过程、细胞组成和分子功能三方面均发挥作用,并影响抗原加工提呈、Toll样受体、维甲酸诱导基因-Ⅰ样受体和心肌功能等相关信号通路。
结论circRNA可能通过宿主免疫调控参与IAV的感染过程。