【摘 要】
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目的 检测活化白细胞黏附分子(ALCAM)基因敲除后苯并[a]芘(BaP)恶性转化细胞THBEc1转录组的改变,探究ALCAM在BaP致癌中的作用,为进一步阐明BaP致癌机制提供线索.方法 选择两
【机 构】
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北京大学公共卫生学院,食品安全毒理学研究与评价北京市重点实验室,北京100191
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目的 检测活化白细胞黏附分子(ALCAM)基因敲除后苯并[a]芘(BaP)恶性转化细胞THBEc1转录组的改变,探究ALCAM在BaP致癌中的作用,为进一步阐明BaP致癌机制提供线索.方法 选择两株ALCAM基因纯合敲除THBEc1细胞THBEc1-△ALCAM-c5和THBEc1-△ALCAM-c7及一株敲除对照细胞THBEc1-ctrl作为模型,利用转录组测序技术筛选细胞间差异表达基因,使用DAVID数据库对差异表达基因进行GO分析和KEGG通路富集分析.利用克隆形成实验检测ALCAM敲除对THBEc1细胞增殖的影响.结果 转录组测序共发现336个基因在两株ALCAM敲除THBEc1细胞和THBEc1-ctrl细胞中表达差异在2倍以上(FDR＜0.05),其中62个基因在两株ALCAM敲除THBEc1细胞中的表达低于THBEc1-ctrl细胞,274个基因在两株ALCAM敲除THBEc1细胞中的表达高于THBEc1-ctrl细胞.差异表达基因涉及多种生物学功能,主要包括细胞增殖、迁移、黏附、信号转导、凋亡、血管生成、炎症反应和免疫应答等.克隆形成实验证实ALCAM敲除可降低THBEc1细胞增殖能力.结论 敲除ALCAM后BaP恶性转化细胞THBEc1转录组明显改变,增殖能力明显降低.ALCAM可能在BaP致癌中发挥重要作用,并可能作为BaP致癌的潜在生物标志物.
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