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在水稻（IR64×Azucena)DH群体中应用分子标记连锁图，对不同供氮水平下的穗长性状进行QTL区间作图分析。在高氮水平下检测到控制穗长的QTLs2个，分别位于第1和第4染色体上；在低氮水平下检测到5个穗长QTLs，其中3个分别位于第1、4和6染色体上，2个位于第3染色体的不同部位，说明穗长QTL与供氮水平之间可能存在交互效应。基于这种互作效应及研究中观察到的两供试亲本对低氮胁迫的耐性差异，推测仅在低氮水平下检测到的穗长QTLs可能跟水稻对低氮胁迫耐性有一定的关联。