基于高通量测序分析相同饲养模式下河谷藏鸡与白来航鸡肠道细菌群落分布特征

• 作 者: 贾福晨 秦良云 李丹丹 刘江 罗章
• 机 构: 西藏农牧学院食品科学学院
• 出 处: 高原农业
• 发表日期: 2018年6期
• 关键词: 河谷藏鸡 白来航鸡 高通量测序 肠道微生物 Tibetan chickens White Leghorn chickens high-throughput se
• 基金项目: 食品科学与工程重点学科建设（2017ZDXK-01）502218009,西藏自治区特色农产品加工贮藏团队（2018KYTD-02）,食品科学与工程专业教学团队建设（2016JXTD-01）,食品科学与工程重点实验室.

本研究旨在研究笼养河谷藏鸡（HGZJ）与白来航鸡（BLHJ）肠道细菌群落分布特征，探究相同饲养模式下两个不同品种鸡肠道内微生物菌群的组成及其差异。随机收集藏鸡组（I组、II组），白来航鸡（Ⅲ组、Ⅳ组）的新鲜粪便各3份，应用16SrRNA基因V3-V4可变区进行高通量测序，研究笼养河谷藏鸡与白来航鸡粪便样品细菌群落组成与结构特征。结果表明：在门水平上，厚壁菌门（Firmicutes）在HGZJ、BLHJ中都是优势种群，相对丰度分别为53.53%和76.18%。在科水平上，乳杆菌科（Lactobacillac