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在内皮细胞间质转化（Endo-MT）过程中，内皮细胞间连接丢失，失去内皮细胞特异性标志物血小板-内皮细胞黏附因子（CD31）和VE-钙黏蛋白（VE-cadherin），获得间质细胞特异性标志物ɑ-平滑肌肌动蛋白(ɑ-SMA)、波形蛋白和成纤维细胞特异性蛋白1( FSP1)等，并获得间质细胞运动和收缩的特性，由原来的鹅卵石样结构转变为细长梭形结构，同时其侵袭力明显增强。转化生长因子-β、Notch信号、Wnt信号以及MicroRNAs等参与对内皮间质转化的调节。Endo-MT参与了各种疾病，如肿瘤、心、肺、肾等重要器官纤维化的发生、发展。