【摘 要】
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当肽段的氨基酸序列长度不等时,建立活性肽定量构效关系(QSAR)模型具有一定困难。自交互协方差(ACCs)技术虽然能够建立肽段不等的模型,但是预测效果并不理想。本研究提出1种
【机 构】
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中国农业大学食品科学与营养工程学院,教育部功能乳品重点实验室
【基金项目】
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国家重点研发计划项目(2018YFD0901102)。
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当肽段的氨基酸序列长度不等时,建立活性肽定量构效关系(QSAR)模型具有一定困难。自交互协方差(ACCs)技术虽然能够建立肽段不等的模型,但是预测效果并不理想。本研究提出1种两端排序法(TTPN)。首先从数据库中查找序列长度最短的肽,以氨基酸数量为基准,分别对每条肽的C端和N端取基准数量的氨基酸残基,组成新的,用于表征其结构的序列。之后建立描述变量矩阵X,活性数据矩阵Y进行定量构效关系(QSAR)研究。为验证TTPN法的有效性及适用范围,收集并建立3个数据库:苦味肽(BT)数据库、降血压肽(ACE)数据库
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