【摘 要】
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目的：利用美国Agilent公司的Agilent sureselect富集液相芯片靶向序列捕获技术和Illumina二代测序平台构建的HIVID方法对20种亚型的HPV在维吾尔族宫颈癌患者基因组中的整合情况进行检测，探讨该人群中HPV宿主细胞基因组整合特点，为维吾尔族女性宫颈癌的防治提供分子流行病学依据。方法：从新疆医科大学附属肿瘤医院肿瘤防治研究所获得40例既往显示HPV感染阳性的维吾尔族宫颈癌
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目的：利用美国Agilent公司的Agilent sureselect富集液相芯片靶向序列捕获技术和Illumina二代测序平台构建的HIVID方法对20种亚型的HPV在维吾尔族宫颈癌患者基因组中的整合情况进行检测，探讨该人群中HPV宿主细胞基因组整合特点，为维吾尔族女性宫颈癌的防治提供分子流行病学依据。方法：从新疆医科大学附属肿瘤医院肿瘤防治研究所获得40例既往显示HPV感染阳性的维吾尔族宫颈癌冷冻标本，并收集其既往HPV检测数据。从美国Agilent公司订制专门设计的针对20种HPV亚型的富集液相芯片，通过靶向序列捕获技术和二代测序技术检测标本中的HPV宿主细胞基因组整合情况，并对相关基因进行GO功能注释分析和KEGG通路富集分析。结果：1. HIVID检测到的HPV多重感染率高达92.5%，远高于商品化试剂盒35.0%的检出率（P<0.05）。2. 40例标本中存在13423个整合事件，总共涉及到6867个人类基因。这些整合事件在人类各条染色体上都有分布，其中19号染色体存在整合事件过度集中的现象，而22号染色体上涉及的基因存在实际观察值远低于期望值的现象。3. HPV宿主细胞基因组整合事件最高发于基因间区以及基因的内含子区域，占所有整合事件的89.25%。同时发现了PPP1R37 ， HECW2 ， EMBP1 ， ANKRD50 ， SPTBN4 ， LINC00895，LYRM4-AS1，LINC00374，RBFOX1，CSMD1，CDH13和KLHL4等高频整合位点。4. HPV基因组的各个基因区域均可以出现插入断点，各基因出现插入断点的频率从高到低分别是E6，E1，E7，L2，E2，L1和E5基因。其中E1和E6基因的整合次数的实际观察值远远高于期望值，而E5基因的整合次数的实际观察值远远低于期望值。5. GO功能注释分析结果显示binding分子功能和cellular process生物学过程是HPV宿主细胞基因组整合现象影响细胞生物学行为的主要途径。而KEGG通路富集分析结果显示，pathways in cancer通路是HPV宿主细胞基因组整合现象涉及到的基因最主要的富集通路。结论：1. 应该重视HPV宿主细胞基因在基因区间高发的现象。2. 维吾尔族宫颈癌患者中HPV整合的高频位点绝大部分和癌症发生进展相关，应该重点研究。3. 应该重视维吾尔族宫颈癌患者中HPV多重感染的问题。
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