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时间序列的非平稳性问题是一直计量经济学领域重要的研究课题之一，如果忽略平稳性假设前提，会导致出现虚假回归、虚假Granger因果关系等一系列问题，因此在进行计量经济实证分析时，首先要讨论使用变量的非平稳性，以保证研究结论的真实性和可靠性。 本文首先对非平稳性的检验方法——单位根理论进行了详细的阐述。对于D-F检验、ADF检验、PP检验、DFGLS检验、KPSS检验等常用经典单位根检验方法的发展历史做了仔细的梳理，并采用这些方法对中国和日本的实际GDP及货币供给M2变量进行了单位根分析。通过观察变量的散点图，确定了变量中包含有时间趋势，而对于趋势种类究竟为线性还是二次趋势，使用了Johansen(1995)的协整分析方法进行了讨论，如果一个时间序列变量显示出与一个二次时间趋势是非协整的，则可以得到这个序列是非平稳的(或包含单位根)包含二次时间趋势的过程。最终得到所研究的时间序列都是包含二次趋势的一阶单整过程。在此基础上，本文对Saikkonen和Luukkonen(1993)提出的MA单位根检验进行了论述。与DF等单位根检验不同，MA单位根检验的零假设是序列为平稳序列，且是针对序列的移动平均部分进行检验。由于时间序列的单位根检验往往具有低势的特征，将MA单位根检验作为一种检验方法与其他方法进行比较和补充，对更好的判断时间序列的单整性具有重要的参考价值。本文使用Morimune和Zhao(1997)给出的MA单位根的简化方法，采用OLS估计估算单位根统计量，避免了计算复杂的协方差矩阵，可以证明该统计量具有一致性，这一简化方法使得MA单位根检验的可操作性大大提高。在使用这一MA单位根简化方法对中日两国实际GDP及货币供给M2变量进行单位根检验后，得到与其他四种单位根检验方法，包括ADF检验，DFGLS检验，KPSS检验以及PP检验，相一致的结论，对判断所考察变量的单整性提供了有效的支持。 在判断变量的单整性后，就需要对非平稳变量之间的关系进行分析。本文对协整关系研究的发展历程及相关的重要定理进行了理论回顾。而对Granger因果关系，则主要基于对其定义的准确把握和方法的适用性上进行讨论。本文试图强调Granger因果关系不同于一般意义下的因果关系，在对实证结论进行解释时，要充分考虑到两者之间的不同。而在应用Granger因果检验时，应充分考虑到该方法的适用条件，即对变量平稳性的限制，为说明这一点的重要性，本文专门对非平稳情形下可能造成的虚假Granger因果关系进行了研究。He和Meakawa(2001)通过模拟证明了，两个相互独立的非平稳时间序列，在进行Granger因果检验时，会得到存在因果关系的结论，即出现虚假的Granger因果关系，并给出了此时统计量应服从的真实分布。本文在此基础上，针对小样本情形，进行了蒙特卡洛模拟，得出了两组小样本的非平稳时间序列，同样可能产生虚假因果关系，且本文模拟出了He和Meakawa推导出的分布在不同样本下的临界值。 本文在使用向量误差修正模型重点考察变量之间长期和短期相互影响的基础上，对通过协整方程中的动态机制研究长期均衡关系，利用误差修正项考察变量关于长期系数的弱外生性，通过差分后的滞后变量分析Granger因果关系等也进行了详细的说明，还特别强调了同一Granger因果关系结论可能解释成为两种截然相反的因果关系。本文使用了中国的实际GDP和M2数据在此框架下进行了因果关系分析，实证结果表明从1997年1季度到2009年4季度，中国的实际产出和货币之间不存在协整关系，即不存在长期均衡关系。将数据进行差分后建立向量自回归模型后进行Granger因果检验，发现在短期内，实际GDP和M2双方向均不存在Granger因果关系。一方面说明了我国货币具有外生性，另一方面可能与我国货币变量的滞后性有关。 此外，本文介绍了多种非平稳情形下Granger因果检验的方法，包括Toda和Phillips(1993)，Toda和Yanamoto(1995)，以及因果测度理论(Hosoya，1997)和非参数检验(Hitomi和Kawasaki，2008)等前沿方法。 本文的最后一章，是对货币长期中性理论的研究。货币是否为中性的，一直是宏观经济学家所关注的话题，尽管在经济理论中，货币的长期中性往往被假设是成立的，而在实证研究中，真实的结果却并非这么简单，人们一直试图检验货币的长期中性。本文对货币长期中性检验的历史发展做了回顾，对Fisher和Seater(1993)提出的在一个二元系统框架下进行货币长期中性检验的方法，做了详细而系统的介绍。本文特别研究了使用该方法的前提，Fisher和Seater提出使用该二元系统进行货币长期中性检验，要求货币变量具有一个持久性的变化，即存在随机趋势，因此对变量的单整性有很细致的讨论。此外还要求货币变量是外生的，但并未对检验办法做明确介绍。本文结合Rahman, Toyoda和Morita(2008)的观点，认为使用Fisher和Seater方法的前提如下:第一，货币变量应至少为一阶单整的，即需要包含有持久变化;第二，货币供给和实际产出之间不存在协整关系，因为协整关系本身就足以拒绝长期中性假设的成立，且若存在协整关系，Fisher和Seater所给出的差分形式的向量自回归模型，将忽略掉长期变化项，显然是欠合理的;第三，对货币外生性的检验，可以通过对差分后变量得到向量自回归模型进行Granger因果检验，考察实际GDP是否为货币供给的Granger原因来判断，如果实际GDP不是货币供给的Granger原因，则可认为货币变量是外生的。 本文使用对中国1997年1季度至2009年4季度的数据，以及日本1990年1季度至2010年4季度的数据，进行实证分析。在对三个前提条件进行验证后，使用Fisher和Seater的方法进行研究，发现样本期间内中国货币长期导数是发散的，表明货币在长期内是非中性的，基于这一结果认为，近年我国的货币政策在影响实际经济上是有效的;而在1990年后日本经济持续低迷的20年内，日本货币呈现长期中性，其货币政策对于经济的实际影响是有限的。