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近年来，禽流感病毒已在全球形成了大范围流行。流感病毒特有的分子结构在自然界显现了高突变速率及抗原性频繁改变的特征，对公共卫生事业与人类健康造成了严重威胁。目前，不同亚型禽流感病毒与高致病性H5N1亚型之间的关联性、变异及进化速率等科学问题，仍然是本领域的研究重点。
论文第一部分，采用分子克隆技术与病毒全基因组分析方法，对80年代3株不同亚型的低致病性禽流感病毒8个基因片段分别完成了克隆与序列测定。3株病毒基因序列同源性分析结果显示3株病毒分属H10N4，H10N5，H7N8亚型。3株病毒命名分别为A/duck/Hubei/137/1985/H10N4，A/chicken/Hubei/119/1983/H10N5，A/duck/Hubei/126/1985/ H7N8。通过序列比对分析描述了3株病毒的分子特征。采用MEGA和BEAST等软件进行系统进化分析，结果显示：1、低致病性禽流感病毒为goose/Guangdong/1/96/H5N1提供了部分内部基因；2、goose/Guangdong/1/96/H5N1的内部蛋白M，PB2，NS的祖先基因，早在80年代就循环在中国南方的低致病性病毒中；3、goose/Guangdong/1/96/H5N1及变异的流行株的内部基因可能起源于92-97年期间水禽中流感病毒。动物感染实验显示3株病毒对雏鸡，小鼠均为低致病性。本研究结果为进一步开展不同亚型禽流感病毒与高致病性H5N1亚型之间的关联性研究提供了科学依据。
论文第二部分，利用杆状病毒蛋白表达系统构建了含有H5和H9亚型HA基因的Bacmid，并转染了SF9细胞，获的了重组杆状病毒，为下一步研究重组蛋白的表达奠定了基础。