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本论文回顾了Mn氧化物和Cu氧化物（侧重于电荷条带）的研究历史和现状,并简要介绍了原子模拟方法的理论基础。通过系统的原子模拟,研究了Ca/Sr掺杂LaMnO3中的原子分布和局域结构。在La1/3Ca2/3MnO3中,发现低温下掺杂Ca2+离子有有序排列的趋向。除证实了其它研究者提出的Wigner-crystal模型和bi-stripe模型外,我们还发现一种新的可能的电荷有序模型:layer-stripe模型。在这种模型中,La3+和Mn3+离子形成类似LaMnO3的局域结构,而Ca2+和Mn4+离子形成类似CaMnO3的局域结构,这两类局域结构和平均结构有明显的不同。layer-stripe模型有普适性,在其它掺杂浓度下,如La2/3Ca1/3MnO3和La1/2Ca1/2MnO3中,它也可以与其它有序模型共存。在La1-xSrxMnO3（x≤1/4）中,我们证实Sr趋于团簇分布而不是无序分布,发现La3+和Sr2+离子附近局域结构有明显的不同。通过对La2-xSrxCuO4（x≤1/3）超导体的原子模拟研究,证实了两种公认的domain-wall电子空穴有条带分布,还发现其它几种可能存在的电子空穴有序分布模型,这些模型是quarter-filled或是half-filled的。上述模拟结果和实验结果以及前人的理论结果有相同或类似之处,这说明过渡金属氧化物中电荷有序分布可能是普遍存在的。还研究了不同浓度的Ca/Sr/Co/Ni掺杂LaMnO3中的和压力下的La0.75Ca0.25MnO3和La0.89Sr0.11MnO3中的晶格变化和MnO6八面体变化,并根据这些变化估算了带宽和计算了杨·泰勒能量。计算的杨·泰勒能量和实验结果符合得较好。还用晶格常数计算了晶格应变,发现居里温度和掺杂引起的晶格应变有定量关系。还演示了带宽、杨?泰勒能量和居里温度之间的定量关系,发现居里温度变化的75%是由杨·泰勒能量变化引起的,其余25%是由带宽变化引起的。用这两种定量关系计算的居里温度和实验结果都符合得较好。