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花青素是一类广泛存在于植物中的水溶性色素,作为一种强自由基清除剂,具有抗炎、抗氧化、降血压、降血糖等多种保健功能。紫芽茶树作为一种高花青素含量的优异性茶树资源,其研究与利用越来越受人们的关注。茶树花青素代谢途径的研究起步较晚,相比于模式植物而言还不够成熟。部分参与花青素合成的基因虽已被克隆验证,但是茶树花青素代谢途径是一个复杂的网络结构,受到多个代谢途径的共同影响,由一系列的酶催化完成,其机理的揭示有待进一步探究。茶树紫芽品系9803新梢芽叶全年均表现为紫色,是研究花青素合成机制的天然材料。本研究对湖南农业大学自选紫芽品系9803与绿芽品系9806进行转录组测序及生物信息学分析,在转录组水平上筛选出了与茶树紫芽花青素代谢相关的差异基因,为进一步揭示茶树紫芽产生的分子机理奠定了基础。主要研究结果如下:(1)通过Illumina深度测序,构建了茶树紫芽品系9803和绿芽品系9806共6个转录组文库,去除掉带接头及低质量的reads后,共获得42.83G的高质量数据。(2)通过可变剪切分析,在紫芽品系9803和绿芽品系9806的比较中,发现286个差异AS事件,其中144个差异AS事件在紫芽中上调,142个紫芽中下调。(3)对样本SNP和InDel变异位点数进行分类统计,并对每一个变异位点的染色体位置、变异位点的坐标、变异前后的基因型以及在每个样本中的表达量等信息进行了详细的注释。(4)通过与茶树参考基因组的比对,对茶树基因组中18550个基因的结构进行了优化,获得了8681个新的茶树基因,并对新基因的功能进行了预测。(5)通过基因的差异表达分析,共鉴定出11060个差异表达基因,其中有5289个基因在紫芽中显著上调,5771个基因在紫芽中显著下调;通过对筛选出的差异基因进行功能富集分析,筛选得到42条与茶树花青素代谢相关的unigene,其中比对到参考基因组中的有34条,未在参考基因组中登录的有8条;KEGG富集分析表明,这42个基因被富集到5个代谢通路中,包括类黄酮合成途径、木质素合成途径、黄酮和黄酮醇合成途径、油菜素甾醇合成途径以及参与转录因子的编码。