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处在市场经济转型期的中国，如何调整政府间关系，促进政府发展，成为突破中国政治体制改革“瓶颈”的关键之一。目前，“职责同构”的政府纵向间职能与权力的结合，增加了中国政府间纵向关系的矛盾，阻碍了社会发展。当市场经济体制发展到必须有相应的社会政治体制与之相配套时，中国政府间纵向关系的深入研究就被提上了日程。但是，传统理论研究局限于中央与地方关系，突出对静态的中央与地方之间的职责权限划分。本项研究努力将这一研究拓展为对中国政府间纵向关系的动态分析，以推动理论研究的深入和对策工作的有效性。 本项研究主要由七个部分组成，除了第一部分提出问题和阐释学术研究的意义、研究方法、研究范围和主要研究特点外，第二部分到第七部分，分别研究了政府间纵向关系的概念、研究模式和基础理论，追溯了当代中国政府间纵向关系的历史发展;比较分析英国、法国和日本等政府间纵向关系发展及其特点，综合分析了制约着政府间纵向关系发展的各方面因素构成的体系;分析了当前中国政府间纵向关系发展面临的种种现实问题，并在此基础上提出建立伙伴型政府间纵向关系的总的对策性思路，并对今后一个时期内的政府发展进行展望。 本项研究的主要特点在于:第一，新颖的研究视角。以“职责同构”为理论研究的切入点，摆脱“集权—分权—再集权”的历史循环所带给人们的固定的思想模式，致力于寻求能够平稳地解决政府间纵向关系的一个新角度。第二，拓宽的研究范围。将对中央与地方关系研究拓展为政府间纵向关系研究，并且把重点放在对当代中国政府间纵向关系的现实分析和相关对策分析。第三，开放的研究平台。研究方法在整体使用上是开放的，并且广泛借鉴了经济学、社会学、统计学、管理学等领域的理论和研究方法，形成跨学科多领域的研究。 本项研究努力在以下几个方面实现一定程度上的理论观点和方法上的创新:(1)本文首次从政府职责与政府层级结构、政府机构的结合角度比较分析，现代政府间纵向关系以“职责异构”为主要特征，以适应平衡国家整体与部分的关系和满足日益增长的公共服务的社会需求。目前，中国必须打破“职责同构”的政府管理体制，调整政府间纵向关系，才有可能推动政府发展和社会进步。(2)为调整政府间纵向关系，缩小地方发展差距，本文提出“城市平衡论”的观点，认为应通过增加直辖市、大城市和中心城市的数量，提升城市自我管理能力，突出大城市及都市连绵区在调整政府间纵向关系中的政治平衡作用。(3)创建伙伴型政府间纵向关系权力结构，即在实现政府间纵向分权的基础上，强调中央政府的“再集权”，促进政府间合作与相互依存关系的形成，完善政府间纵向权力监督保障机制。