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上世纪90年代初，为全面推进科技与经济体制改革，大幅度提高综合国力与国际竞争能力，我国政府有选择的在全国范围内开始部署建设国家高新区。经过近20年的发展，我国531个国家级高新区基本上跨越了产业集聚阶段，但是53个高新区所处的发展阶段不同，有些发展较好的高新区已经发展到集群创新阶段，另外一些高新区仍然停留在产业集群阶段。此外，53个高新区的产业实力、研发实力、产业效率和研发效率差异悬殊。产业基础和研发能力是相互依存的，没有良好的产业基础，研发能力无从谈起；没有一定的研发能力，产业升级缺乏动力。53个高新区在未来的发展中面临着同样的问题，即如何立足于自身的发展状况，选择合适的发展战略，建设创新型科技园区。
本文从在综述已有研究的基础上，从战略定位和创新模式两个纬度对高新区发展战略的差异化选择进行思辨，认为具有不同发展环境和处于不同发展阶段的高新区应该采取差异化的发展战略。在此基础上，利用火炬中心2002、2003和2005三个年度的统计数据，制定高新区实力和效率的评价体系，采用SPSS统计工具的因子分析功能，对53个国家级高新区的产业实力、研发实力、产业效率和研发效率进行评价。依据评价结果，将53个国家级高新区分为七个类别。基于分类结果和各类别的特征，判断各类高新区所处发展阶段，进而从战略定位、战略目标和重点任务三个方面制定不同类型高新区的发展战略。在战略定位方面，处于要素集聚阶段的高新区应定位在产业基地，壮大产业基础；处于产业集群阶段的高新区应采取集群整合战略，整合产业基础，推动产业升级，促进研发创新；处于区域创新阶段的高新区应定位在创新基地，打造高新区创新体系，促进原始性创新，把创新作为高新区发展的不竭动力。在创新模式的选择方面，处于产业集聚阶段高新区，创新实力较弱，园区创新行为很少，创新活动应该侧重于跟进型：处于产业集群阶段的高新区，产业实力显著增强，研发实力有所提高，创新活动应该侧重于跳跃型；集群创新阶段的高新区，研发实力显著增强，应该尝试原创性创新。