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高原湖泊具有蓄排洪、工农业和生活用水、水产以及气候调节等功能，其流域区往往成为社会经济发展的中心区和重要的生态功能区，具有重大意义。随着社会经济发展，湖泊资源开发日益加剧，面临着水资源短缺和水生态环境恶化的局面，因此，建立可靠的高原湖泊水质生物监测评价体系有重要的现实意义。大型底栖动物对水体环境变化敏感，是湖泊水质和生态质量评价中非常合适的指示生物。
本研究以大型底栖动物作为研究对象，在云南省高原湖泊设置11个样点，采集底栖动物和水质样品，研究高原湖泊流域底栖动物群落结构及其水质生物评价，以期为高原湖泊的生态学管理、环境保护以及资源的可持续利用提供科学的依据。
一、在高原湖泊鉴定出大型底栖动物99个分类单元(taxa)，隶属于3门6纲50科75属。其中，环节动物门包含寡毛纲和蛭纲，2纲9科12属;软体动物门包含腹足纲和双壳纲，2纲10科16属;节肢动物门包含昆虫纲和软甲纲，2纲31科41属。各湖区物种数由多到少依次为阳宗海，杞麓湖，九溪湿地和异龙湖;物种总数最高出现在8月，有60种，最低在2月，18种，夏秋季高于冬春季。
二、底栖动物年均密度为943 ind/m2，年均生物量49.859g/m2。其中，全流域环节动物年均现存量为408ind/m2和1.612g/m2，软体动物321ind/m2和42.359g/m2，节肢动物214 ind/m2和5.889g/m2。各湖区流域中现存量最高的类群:杞麓湖的为环节动物，阳宗海的为软体动物，九溪湿地的为节肢动物。绝对密度优势群:阳宗海的是软体动物，杞麓湖的是环节动物，异龙湖和九溪湿地的是节肢动物。绝对生物量优势群:九溪湿地的为节肢动物，其它三个湖泊流域均为软体动物。各湖泊流域环节动物现存量6月份最高，2月份最低，夏季高于其它季节;软体动物密度最高的在4月，最低在6月，生物量最高在6月，最低在2月，现存量为春季高于其它季节;节肢动物密度最高在4月，最低在2月，生物量最高在6月，2月最低，现存量春夏高于秋冬。
三、优势种时空分布:阳宗海流域以囊螺属为主;杞麓湖流域以寡毛类为主;异龙湖以摇蚊和囊螺属占优;抚仙湖．星云湖流域优势种密度最大者为摇蚊和钩虾属，生物量则以钩虾属为主。4月份钩虾属密度最高，椭圆萝卜螺则生物量最高;6月寡毛类密度占优，萝卜螺属则生物量占优;8月摇蚊类密度占优，圆田螺属生物量占优;10月密度最高的为带丝蚓科，生物量最高的为米虾属;12月苏氏尾鳃蚓密度最高，铜锈环棱螺生物量最高;2月囊螺属现存量最高。总体上，优势种除8月缺失环节动物和2月都是软体动物外，其它月份均出现三大类群。
四、应用TWINSPAN分类和CA排序方法揭示高原湖泊底栖动物群落连续性和间断性特征。研究表明，高原湖泊流域存在4种底栖动物群落类型，该分布特征体现了水质变化梯度。CCA排序双轴系中，轴1主要反映水温、亚硝酸氮和总碱度梯度变化，与总碱度呈负相关，与水温、亚硝酸氮呈正相关。轴2主要反映酸碱度和硝酸氮梯度变化，与pH值为负相关，与硝酸氮和砷呈正相关。
五、运用Shannon-Weaver指数(H)、Margalef丰富度指数(dM)、科级生物指数(FBI)和生物学污染指数(BPI)评价了高原湖泊水质。对上述四种指数进行相关性分析，发现BPI与其它三项指数均密切相关(p＜0.01)，dM和H密切正相关(p＜0.01)。再将这四项指数和理化指标水质评价结果进行相关性分析，发现BPI水质评价结果和理化指标及FBI的评价结果呈显著正相关(p＜0.05)，H和dM评价结果存在极显著正相关(p＜0.01)。故此次水质评价，以BPI为主要评价指数，同时为了提高评价结果的可靠性，综合采用多种生物指数并结合理化指标进行水质生物评价。
综合评价发现，阳宗海12月污染程度显著高于其它月，杞麓湖6月水质污染显著高于其它月，抚仙湖，星云湖流域10月水质污染高于其它月。总的来说，阳宗海及抚仙湖-星云湖流域水质评价为中污染，有机负荷和营养水平较高;杞麓湖和异龙湖流域水质为重污染，处于高有机负荷和营养水平。