Ⅰ型DHV分离株全基因组序列分析及嵌合病毒全长cDNA克隆的构建

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鸭病毒性肝炎(Duck viral hepatitis,DVH)是由鸭肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)引起雏鸭的一种急性、致死性、高度接触性病毒传染病。主要临床表现为痉挛、抽搐和角弓反张等神经症状,并以肝脏肿胀和表面树枝状充血或出血斑点为特征性病理变化。DHV分为3个血清型,Ⅰ型和Ⅲ型属于小RNA病毒科,Ⅱ型属于星状病毒科,3个血清型之间没有交叉保护作用。我国主要流行Ⅰ型DHV,但近年来,DHV出现了新的流行趋势,常用的Ⅰ型DHV弱毒疫苗或灭活疫苗对该病的防治效果不理想,国内外学者陆续报道分离到DHV-Ⅰ变异株,称为新型DHV。目前,Ⅰ型DHV已经成为危害全球养鸭业的主要疾病之一,带来重大的经济损失。因此,对DHV进行深入研究具有重要的意义。  本研究对华南地区不同养鸭场疑似DHV病例,经鸭胚接种分离纯化,共分离出三株DHV。通过动物回归试验、半数致死量ELD50的测定、鸭胚中和试验等确定为血清Ⅰ型DHV;同时通过RT-PCR检测,从基因分型角度验证分离毒为DHV-Ⅰ,将DHV分离毒株分别命名为A-CY株、H-CY株、GD株。  根据已发表的Ⅰ型DHV全基因组序列设计并合成引物,对三株DHV分离毒株A-CY株、H-CY株、GD株,通过RT-PCR方法,对其基因组序列进行分段克隆扩增并测序。经过生物学软件的拼接处理,成功获得三株Ⅰ型DHV分离毒株的全基因组序列,结果,不含poly(A)尾的DHV-Ⅰ基因组全长约7690bp,只含有一个多聚蛋白(ORF),编码2249个氨基酸。将其与已发表的DHV参考毒株进行比对和遗传进化分析,结果表明:DHV分离毒株A-CY株、H-CY株、GD株处于DHV-Ⅰ的分支,彼此具有不同程度的亲缘关系,但与台湾新型和韩国新型DHV毒株处于的不同分支,核苷酸和氨基酸的同源性都比较低。因此,认为三株DHV分离毒株A-CY株、H-CY株、GD株都应归类于传统的DHV-Ⅰ。  根据本实验室已经建立的Ⅰ型DHV的SS株感染性克隆反向遗传操作平台,通过融合PCR技术,研究将SS株的VP1蛋白替换为新型DHV强毒QY3株的VP1蛋白,经菌液PCR和测序验证表明,成功构建出以Ⅰ型DHV SS株为骨架的嵌合病毒全长cDNA克隆。为深入研究DHV嵌合病毒的生物学特性、以及衣壳蛋白VP1对DHV的致病机理影响奠定基础。  
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