论文部分内容阅读
大白菜根肿病由芸薹根肿菌(PlasmodiophorabrassicaeWoron)侵染引起，是危害十字花科作物的一种世界性土传病害。本研究利用无参RNA-Seq技术，对接种根肿菌后的根系进行转录组测序，通过与不同的基因组数据库比对，进行功能注释，并利用生物技术平台筛选出根肿菌侵染后根组织表达有差异的基因，从细胞周期和胼胝质积累两方面初步探讨大白菜响应根肿菌侵染的分子机理。研究获得如下结果：1.应用无参RNA-Seq技术构建大白菜根组织转录组，共获得20.8Gb的数据量，Denovo组装后获得Unigenes65128条；Genemapping分析有53045条Unigenes得到注释。差异表达分析共筛选出差异基因4986个，其中下调基因3394个，上调基因1592个。KEGG分析发现111条代谢通路，涉及1672个差异基因。2.应用荧光定量PCR，对细胞周期中︱LOG2(TR/CK)︱≥2差异表达基因进行相对定量分析。结果表明，根肿菌侵染大白菜根后多个与细胞周期相关基因表现差异，转录组测序结果与荧光定量表达结果一致。侵染后促细胞周期基因CDKA;1、DOF1.7、CDKB1;1表达量上调，而抑细胞周期基因DELLA-RGA1表达下调，从而加快启动细胞周期，调控细胞增殖。3.应用荧光定量PCR，对胼胝质沉积中︱LOG2(TR/CK)︱≥2差异表达的基因进行相对定量分析。结果表明，根肿菌侵染大白菜根多个胼胝质沉积相关基因表现差异，转录组测序结果与荧光定量表达结果一直。胼胝质合成酶基因GSL3、GSL4、GSL6下调表达，胼胝质酶(β-1.3-葡聚糖酶)基因BG13、BG14则上调表达，从而抑制胼胝质沉积，导致细胞壁防御功能下降。