【摘 要】
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本试验参考牛疱疹病毒I型全基因序列NC001847(GenBank)分别设计5对特异性引物，以牛传染性鼻气管炎病毒内蒙古分离株。NM06株提取的总DNA为模板，运用PCR的方法分别扩增5个基因的
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本试验参考牛疱疹病毒I型全基因序列NC001847(GenBank)分别设计5对特异性引物，以牛传染性鼻气管炎病毒内蒙古分离株。NM06株提取的总DNA为模板，运用PCR的方法分别扩增5个基因的cDNA，将获得的cDNA连接到PMD19-T质粒载体中，并进行克隆，经PCR鉴定后的阳性重组质粒送宝生物工程(大连)有限公司进行测序。结果表明，内蒙古分离株NM06的gE基因长2086bp，包含1个1728bp的完整开放阅读框，编码576个氨基酸；gI基因长1280bp，包含1个1149bp的完整开放阅读框，编码383个氨基酸；gG基因长1599bp，包含1个1335bp的完整开放阅读框，编码445个氨基酸；gN基因长为1459bp，包含2个完整开放阅读框，第1个由291bp组成的完整开放阅读框，编码的是gN基因，编码区共编码97个氨基酸：第2个由777bp组成的完整开放阅读框，编码的是VP22基因，编码区共编码259个氨基酸。
将NM06株gE、gI、gG、gN及VP22基因序列分别与参考毒株相应的基因序列进行同源性比较结果发现，NM06gE基因与其它毒株的核苷酸同源性在93.4％～99.9％，推导氨基酸同源性在83．8％～99．8％NM06gI基因与其它毒株的核苷酸同源性在96．2％～99．8％，推导氨基酸同源性在89．2％～99.5％；NM06 gG基因与其它毒株的核苷酸同源性在97.4％～99．8％，推导氨基酸同源性在95．9％～99．5％；NM06gN基因与其它毒株的核苷酸同源性均为99.3％，推导的氨基酸同源性均为97.9％；NM06 VP22基因与其它毒株的核苷酸同源性均为100％，推导氨基酸同源性在99．6％～100％。NM06株5个基因的基因序列与BHV-5各毒株相应的基因序列核苷酸同源性在71.7％～82.9％，推导氨基酸同源性在69.5％～82．6％。构建的遗传进化树分析结果显示，NM06株与分离自瑞典的can kao株和cooper株位于1个进化分支，与BHV-5和CvHV-2不在1个进化分支上，以上结果表明IBRV NM06株与瑞典株亲缘关系较近。根据同源性比较分析和遗传进化树分析结果，确定IBRVNM06株为BHV-1(1.1)型。
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