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慢性ITP是临床常见的出血性疾病,其发病机制主要与免疫反应有关,巨核细胞增殖发育成熟障碍和血小板生成障碍在发病过程中也起着重要作用,但其详细的病理生理学机制尚未完全阐明。
近年来,有研究发现,急性ITP患者在外周单核细胞、外周血T细胞、外周血B细胞均有差异表达的miRNA谱,揭示miRNA可能参与ITP的发病机制,但在血小板方面研究较少。不禁让我们猜想,对于慢性ITP患者,会不会也存在差异表达的miRNA谱?对于其他小RNA,如piRNA,会不会也存在差异表达?本实验通过对比研究慢性ITP与健康对照者差异小RNA,旨在进一步揭示慢性ITP发病机制,为治疗提供新的方向。
目的:分析慢性ITP患者与健康对照者血小板中表达的差异小RNA,寻找与慢性ITP发病相关的调控基因,从基因组水平揭示慢性ITP的新的发病机制,为慢性ITP提供新的分子治疗靶点的依据。
方法:选取2018年6月至2019年01月就诊于汕头大学医学院第二附属医院血液内科确诊为慢性ITP的患者5例,另外随机选取该院体检中心的体检健康者5例作为对照。提取外周血小板的RNA,并外送华大基因公司行小RNA测序。
结果:1、ITP组与对照组在年龄(P=0.454)、性别(P=0.58)上差别无统计学意义,在血小板计数(P<0.01)上差别具有统计学差异;2、ITP组与对照组在Totaltag(P=0.523)、Mappedtag(P=0.299)数量上差别无统计学意义;3、ITP组与对照组的小RNA进行对比,有1510个miRNA表达上调,显著上调的有hsa-miR-4508;hsa-miR-4516;hsa-miR-1224;hsa-miR-4804;有737个miRNA表达下调,较显著下调的有hsa-miR-378i;有4327个piRNA表达上调,有629个piRNA表达明显下调,其中novel_pir3020等piRNA显著上调,novel_pir531等piRNA显著下调。4、对于差异表达的小RNA靶基因进行GO功能分析,有13006个基因参与细胞成分,有12163个基因参与分子功能,有12046个基因参与生物过程。5、以KEGG公共数据库对差异基因作Pathway富集分析,有108个差异基因参与“系统性红斑狼疮”的表达通路(P<0.01),有113个差异基因参与“核糖体”的表达通路(P<0.01),有263个差异基因参与“细胞因子受体”的表达通路(P<0.01),有62个差异基因参与“维生素A代谢”的表达通路(P<0.01),有110个基因参与“补体系统”表达通路(P<0.01),有104个差异基因参与“氧化磷酸化”的表达通路(P<0.01),有111个差异基因参与“帕金森病”的表达通路(P<0.01),有81个差异基因参与“类风湿性关节炎”的表达通路(P<0.01)。
结论:1、慢性ITP患者血小板中有显著的miRNA差异表达谱。2、慢性ITP患者血小板中有显著的piRNA差异表达谱。3、核糖体在促进血小板miRNA的翻译功能上起到重要的作用;4、细胞因子受体、补体系统、维生素A代谢、氧化磷酸化多条通路与慢性ITP有密切关系,可能参与其发病过程;5、慢性ITP患者与系统性红斑狼疮、类风湿关节炎有交叉的病理生理学机制。6、慢性ITP可能与帕金森病有共同的信号通路。
近年来,有研究发现,急性ITP患者在外周单核细胞、外周血T细胞、外周血B细胞均有差异表达的miRNA谱,揭示miRNA可能参与ITP的发病机制,但在血小板方面研究较少。不禁让我们猜想,对于慢性ITP患者,会不会也存在差异表达的miRNA谱?对于其他小RNA,如piRNA,会不会也存在差异表达?本实验通过对比研究慢性ITP与健康对照者差异小RNA,旨在进一步揭示慢性ITP发病机制,为治疗提供新的方向。
目的:分析慢性ITP患者与健康对照者血小板中表达的差异小RNA,寻找与慢性ITP发病相关的调控基因,从基因组水平揭示慢性ITP的新的发病机制,为慢性ITP提供新的分子治疗靶点的依据。
方法:选取2018年6月至2019年01月就诊于汕头大学医学院第二附属医院血液内科确诊为慢性ITP的患者5例,另外随机选取该院体检中心的体检健康者5例作为对照。提取外周血小板的RNA,并外送华大基因公司行小RNA测序。
结果:1、ITP组与对照组在年龄(P=0.454)、性别(P=0.58)上差别无统计学意义,在血小板计数(P<0.01)上差别具有统计学差异;2、ITP组与对照组在Totaltag(P=0.523)、Mappedtag(P=0.299)数量上差别无统计学意义;3、ITP组与对照组的小RNA进行对比,有1510个miRNA表达上调,显著上调的有hsa-miR-4508;hsa-miR-4516;hsa-miR-1224;hsa-miR-4804;有737个miRNA表达下调,较显著下调的有hsa-miR-378i;有4327个piRNA表达上调,有629个piRNA表达明显下调,其中novel_pir3020等piRNA显著上调,novel_pir531等piRNA显著下调。4、对于差异表达的小RNA靶基因进行GO功能分析,有13006个基因参与细胞成分,有12163个基因参与分子功能,有12046个基因参与生物过程。5、以KEGG公共数据库对差异基因作Pathway富集分析,有108个差异基因参与“系统性红斑狼疮”的表达通路(P<0.01),有113个差异基因参与“核糖体”的表达通路(P<0.01),有263个差异基因参与“细胞因子受体”的表达通路(P<0.01),有62个差异基因参与“维生素A代谢”的表达通路(P<0.01),有110个基因参与“补体系统”表达通路(P<0.01),有104个差异基因参与“氧化磷酸化”的表达通路(P<0.01),有111个差异基因参与“帕金森病”的表达通路(P<0.01),有81个差异基因参与“类风湿性关节炎”的表达通路(P<0.01)。
结论:1、慢性ITP患者血小板中有显著的miRNA差异表达谱。2、慢性ITP患者血小板中有显著的piRNA差异表达谱。3、核糖体在促进血小板miRNA的翻译功能上起到重要的作用;4、细胞因子受体、补体系统、维生素A代谢、氧化磷酸化多条通路与慢性ITP有密切关系,可能参与其发病过程;5、慢性ITP患者与系统性红斑狼疮、类风湿关节炎有交叉的病理生理学机制。6、慢性ITP可能与帕金森病有共同的信号通路。