【摘 要】
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辨识和分析基因的表达模式对于理解生物体的内在活动机制、针对性的疾病诊断和药物设计具有重要的作用。尽管当前存在多种基因跨组织表达数据如微阵列、EST等，但是如何通过这
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辨识和分析基因的表达模式对于理解生物体的内在活动机制、针对性的疾病诊断和药物设计具有重要的作用。尽管当前存在多种基因跨组织表达数据如微阵列、EST等，但是如何通过这些表达数据有效的划分组织特异性基因并没有统一的标准。本文针对上述问题，集成目前存在的表达数据分析方法，分别对微阵列和EST表达数据进行了分析，并将分析表达数据的方法和结果封装成组织特异性服务平台，通过该平台可以快速获得组织特异性基因。本文的主要内容如下：为了有效的划分组织特异性基因，我们分别对基因的两种表达数据进行了分析。微阵列数据涉及基因在人体84个组织中的表达数据，本文使用SPM和均值方差法判断基因的组织特异性，将通过SPM获得组织特异性基因与均值方差法获得的结果进行比较，两者具有较高的重合率。EST数据包含基因在人体30个组织中的表达数据，可以通过计算EST表达富集值EE的大小，使用p-value的值来判断某个基因是否为组织特异性基因，从而获得每个组织中的组织特异性基因。最后比较了微阵列和EST两种表达数据分析结果，发现两者结果具有较高的重合率，因此可以利用它们划分组织特异性基因。针对当前相关数据库功能较为单一、信息较少,本文构建了组织特异性基因服务平台。该平台将物种信息、组织及组织之间的关系、多种基因表达数据、基因特异性表达分析方法、分析结果、基因的描述信息，基因功能描述文献等融合在一起。平台可以提供多种组织特异性基因查询方式，快速查找某个组织中对应的组织特异性基因，获取基因特异性表达的组织、获得对应的物种、组织及基因的详细信息，浏览下载相关基因功能描述文献，为组织特异性研究提供了服务工具。
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