一种SARS-CoV的分型芯片

来源 :中国疾病预防控制中心 | 被引量 : 0次 | 上传用户:alex851123
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严重性急性呼吸道综合征(severe acute respiratory syndrome,SARS),是一种由新型冠状病毒(SARS coronavirus,SARS-CoV)引起的严重危害人类健康的传染病。综合SARS-CoV病毒的S基因进化分析、SNV突变点分析、流行病学资料和临床症状资料,我们将SARS-CoV分成4种类型,分别为原始群(prototypegroup)、低致病性群(1owpathogenicity group)、高致病性群(high pathogenicitygroup)和流行群(epidemic group)。原始群病毒S基因没有SNV突变点,仅感染动物。低致病性群含2-7个SNV,可以感染人和动物,症状相对温和,传染性低。高致病性群含16-22个SNV,可以感染人和动物,毒力和传染性很强,临床症状较重,病死率较高。流行群含有23-27个SNV,参与了2003年全球SARS流行,患者的临床症状重,传染性强,病死率高。 本研究发展了一种SARS-CoV分型芯片,可快速准确的检测有分型意义的25个SNV,对SARS-CoV进行分型,快速预测疫情发展和患者预后,指导SARS疾病预防控制工作。用51份各类SARS相关标本对芯片进行了评价。芯片检测结果与测序的结果比较,模拟标本检测SNV突变的灵敏度为91.3%,准率为97.5%。有序列资料样品检测SNV突变的灵敏度为92.2%,准确率为93.3%,分型结果的准确率为95%(19/20)。该芯片基本上能够满足区分原始群、低致病性群、高致病性群和流行群的要求。
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