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蓖麻具有耐旱、耐寒等优良种植性状,能够在边际性土地上生长,可以在一定程度上缓解农业种植、食品加工原料等产业所需耕地锐减以及能源危机伴随的众多问题。矮秆品种推广种植过程中,种植密度对蓖麻产量和质量影响的研究报道甚少,同时,矮秆蓖麻和高秆蓖麻品种之间的差异蛋白表达谱的报道更少。本论文选用3个不同高度的矮秆蓖麻品种浙蓖41(50-80 cm)、浙蓖40(81-120cm)和浙蓖32(121-150 cm),采用了5个不同种植密度进行试验,以期寻找各自的最佳种植密度及其产量构成因素,为后续的大田推广奠定理论基础。为了找到矮秆蓖麻表达矮秆性状的特异蛋白,应用蛋白质组学和生物信息学的方法研究了矮秆蓖麻品种天蓖26号和高秆蓖麻品种非洲小粒始花时期的蛋白表达的差异,对利用分子手段改良蓖麻品种和矮秆品种的选育具有重要意义。主要研究结果如下：浙蓖41、浙蓖40和浙蓖32分别在种植密度为36000株/hm2、30000株/hm2和24000株/hm2时,产量达到最高值,对应的最高产量分别为3468.3kg/hm2、3707.1 kg/hm2和3580.1 kg/hm2;单位面积有效果穗数、穗粒数和百粒重三个因素形成了蓖麻群体的产量。其中,单位面积有效果穗数对产量的影响最大。从现蕾期开始,不同种植密度下的蓖麻植株高度开始出现差异,并且开花期到成熟期的差异最明显。种植密度对蓖麻成熟期的各形态指标造成了不同程度的影响,其中植株高度和平均节长与密度呈正相关,其他的形态指标与种植密度呈现负相关。浙蓖41、浙蓖40和浙蓖32的最大含油率分别为52.40%、50.20%和48.30%,最大产油量分别为1817.41 kg/hm2、1773.92 kg/hm2;和1772.13 kg/hm2。通过双向电泳分离,典型高秆和典型矮秆蓖麻品种大约有1000个蛋白点在每张电泳胶图谱中得到分离。通过PDQuest软件分析和质谱鉴定,共鉴定出38个差异蛋白。差异蛋白按其生物学功能主要分为8个大类,涉及多个生物学过程。最大的一类蛋白参与的过程是氧化还原平衡和防卫响应,其次是光合作用。根据蛋白的亚细胞定位分析,这38个差异蛋白分别主要定位于叶绿体(44.8%),细胞质(18.4%),液泡(10.5%),线粒体(2.6%),细胞膜(2.6%)等。