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随着事业单位绩效工资制度的全面实施，其在实现收入分配规范化、体现社会公平、激励社会消费、促进社会和谐等方面作用逐渐显现，但是，一些意料之外的弊病如缺乏激励机制、贡献与收入不匹配等也在逐步浮出水面。如何进一步完善绩效工资制度，推动事业单位实施绩效工资制度沿着良性循环的方向发展值得我们深入探讨。但是，事业单位情况复杂、收入分配体制不尽相同，对其绩效工资制度较难开展整体研究，只能分类分域、以点带面进行研究。与此同时，2013年国家对基层医疗卫生机构实施绩效工资提出了新的要求，作为公益性事业单位在新形势下如何处理好绩效与公益这对看似矛盾的关系，作为已拥有较为成熟绩效考核、收入激励机制的事业单位在实施绩效工资过程中如何实现平稳过渡，尤其值得我们关注。 本文采用了文献研究法、个案分析法、经验总结法等研究方法，对萧山区基层医疗卫生机构实施绩效工资工作进行了深入研究。通过对萧山区基层医疗卫生机构在实施绩效工资前后收入分配体制差异的比较，分析其在实施绩效工资过程中存在的问题及产生的根源，在此基础上提出健全绩效工资总量正常增长机制、完善绩效考核办法、搞活绩效工资分配、确保公平公开公正等完善基层医疗卫生机构绩效工资制度的对策和建议，摸索建立适合萧山区基层医疗卫生机构的绩效分配模式，具有十分重要的现实意义，进而为其他事业单位实施绩效工资制度过程中出现的共性问题的解决提供可借鉴的经验。