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财务信息在社会经济活动中具有重要的地位，其使用非常广泛，政府部门、投资机构、银行、企业和个人等均要运用财务信息来做出决策。只有准确、可靠的财务信息才会有正确的决策，才能保证整个经济的正常运行。要保证财务信息准确与可靠，必须要有一套行之有效的制度和技术来进行控制。这些控制的制度和技术与财务核算处理的运行环境密切相关。
伴随着科技的发展，计算机信息处理技术因高效、准确等优点被认可并逐步地应用到财务领域。财务信息系统是现代社会化大生产和新技术革命的必然产物，也是财务发展史上的一次重大变革。它使财务人员从繁重的传统手工记账、算账、报账工作中解脱出来，大大提高了财务管理和决策的效率，与传统的手工财务相比，现代财务信息系统在计算工具、数据信息载体、账簿形式和财务更正方法、账务处理程序、财务工作流程、组织体制等方面存在差异。这也导致了财务信息系统内部控制与传统手工财务内部控制在控制重点、交易授权与执行、控制范围等方面存在很大不同。
财务信息系统的内部控制是伴随着企业财务信息系统的建立而产生的。内部控制的设计要以财务环境为基础。随着经济的发展和技术的进步，现代信息技术得到了迅猛的发展，当现代信息技术引入到财务信息系统之后，财务信息系统的体系结构发生了几次巨大的变化，而且随着新业务和新技术的不断出现还始终处于不断发展之中，这种财务环境的变化要求在设计内部控制的时候，要采用相适应的控制制度和技术。这也是本文研究的出发点。
本文在内部控制理论的认真研究、总结、借鉴的基础上，运用历史分析和现实分析相联系，归纳与演绎相结合的方法，注重理论联系实际，就加强和完善财务信息系统的内部控制进行有益的探讨。通过详细的调查取证，在对H研究院财务信息系统内部控制的现状进行诊断分析的基础上，针对问题提出具体的完善措施，旨在对其他企业财务信息化内部控制的建立提供一定的指导意义和应用价值。