巴比二氏综合症家系致病基因的筛选、定位及测序

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目的:对中国汉族2个巴比二氏综合症(Bardet–Biedl Syndrome,BBS)遗传性疾病家系进行遗传连锁分析及基因测序,筛选鉴定新致病基因位点和/或新致病基因及鉴定已知基因的新突变,以确认致病基因并阐明致病机理。方法:1.采集中国汉族2个巴比二氏综合症遗传性疾病家系的临床资料和血样标本,提取血样标本中DNA,建立病人的临床信息数据库。2.针对巴比二氏综合症遗传性疾病的已知基因,设计引物进行测序,排除或定位于已知基因。应用遗传连锁方法,选择已知位点及已知基因物理位置附近的STR(short tandom repeat markers)标记物进行已知基因及已知位点的筛查。3.对是已知位点和基因的家系的阳性位点附近有连锁的,在其附近进行进一步的遗传间距更近的遗传连锁分析;对排除已知位点及基因的家系,用382个STR标记物(ABI PRISM Linkage Mapping Sets V2.5-MD ),PCR扩增其片段,采用ABI3100遗传分析仪进行全基因组的扫描。4.用国际公认的遗传连锁分析方法,根据等位基因(单倍体)分型结果,应用两点法,分别计算STR标记物的LOD值(Lod Score值,表明疾病基因与该位点连锁的紧密性大小),以最大LOD值确定阳性位点。5.在阳性位点附近,根据荧光标记的STR(single nucleotide polymophism)基因型检测结果,进行更精细定位,确定疾病基因的最小遗传间距MGI(Minimum Genetic Interval)。在MGI内,通过候选基因法筛选其致病基因及突变。结果:1.建立了中国汉族巴比二氏综合症遗传性疾病家系的临床及临床信息数据库。2.完成了对1个巴比二氏综合症(Bardet-Biedl Syndrome, BBS)疾病家系是已知基因BBS7的连锁定位和测序,发现其是已知基因的新突变,为BBS致病机制的进一步阐明提供了依据。3.完成对1个BBS遗传性疾病家系是已知基因BBS5的连锁定位,测序工作目前正在进行中。4.本课题研究的结论,对于该领域的研究具有重要的学术价值,为以后的基因筛查、基因诊断和基因治疗都起到了很大的作用。结论:1.我们收集了2个中国汉族巴比二氏综合症遗传性疾病家系的临床资料,丰富了神经系统遗传性疾病的遗传资源信息。2.发现了中国汉族1个已知基因BBS7的新突变。
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