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Shrunken2基因编码葡萄糖焦磷酸化酶，是玉米淀粉合成途径中的限速酶，shrunken2是Shrunken2的隐性突变等位基因，对甜玉米品质和风味的形成起着重要的作用。本研究以玉米B73的Shrunken2基因为参考序列，在58份甜玉米自交系中进行shrunken2基因的重测序，共获得了7635bp的核苷酸序列，涵盖了20个外显子，17个内含子以及3UTR区域。基因多态性分析发现，在供试群体中共有多态性位点105个，包括78个SNP和27个Indel。与普通玉米B73的Shrunken2序列之间存在58个多态性位点差异，包括50个SNP和8个Indel，其中位于编码区的SNP位点包含2个同义突变和7个非同义突变。根据shrunken2基因全长序列和编码区序列可将该群体分成9种和4种单倍型。中性检测表明该基因经历了自然和人工双重选择过程。候选基因关联分析结果表明，610bp和3203bp处的等位变异对甜玉米籽粒含糖量贡献的效应值最大，但均未达到显著水平。