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近些年,伴随着DNA分子标记技术的飞速发展与广泛应用,传统育种结合着分子标记技术辅助选择育种早已成为培育鱼类新品系的有效手段。并且,借助分子辅助选择育种这种手段可以寻找到与重要经济性状相关的分子标记或基因。本研究分别从鱼类的重要经济性状如体重、体长、体高、体宽和头长5个生长指标筛选了与罗非鱼生长性状相关的分子标记,并探索了罗非鱼生长性状的调控机理及相互间的作用机制。研究发现,不同家系间或同一家系不同个体间的尼罗罗非鱼其生长速度存在较大差异,而且形态上也存在一定差异,说明群体内遗传多样性比较丰富,在遗传上选育空间比较大。为了保证罗非鱼快长优良性状能够稳定遗传,也为了培育出生长速度更快的新品系,本研究以尼罗罗非鱼中5个基因一MyoD1、MyoD2、Myostatin、GH、IGF2基因作为罗非鱼生长相关的候选基因,采用PCR-SSCP及测序技术获得其SNPs位点,再利用最小二乘法对SNPs基因型与罗非鱼生长性状的关联性进行分析,以获得与罗非鱼生长相关的SNPs分子标记,以期为尼罗罗非鱼的分子辅助育种研究奠定基础。本研究结果如下:1.对尼罗罗非鱼MyoD1基因共检测到8个SNP位点,分别为296A→C、323T→C、617G→C、659A→G、770 C→G、1176G→A、1195C→A、2367A→G,位点平衡性检测发现,有3个SNP位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而5个SNP位点处于Hardy-Weinberg极不平衡状态(P<0.01)。2.对尼罗罗非鱼MyoD2基因共检测到3个SNP位点,分别为636T→C、1127C→T、1357A→T,位点平衡性检测发现,其中位点 1127C→T处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。3.对尼罗罗非鱼Myostatin基因共检测到3个SNP位点,分别为617A→T、725C→T、2129A→C,位点平衡性检测发现,其中位点2129A→C处于Hardy-Weinberg极不平衡状态(P<0.01)。4.对尼罗罗非鱼GH基因检测到1个SNP位点,即1146T→A,位点平衡性检测发现,该位点2129A→C处于Hardy-Weinberg极不平衡状态(P<0.01)。5.对尼罗罗非鱼IGF2基因共检测到6个SNP位点,分别为1017G→T、1018G→T、1075C→T、1467C→T、1472C→G、4438C→T,位点平衡性检测发现,其中3个SNP位点处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05),3个SNP位点处于Hardy-Weinberg极不平衡状态(P<0.01),这些位点都存在等位基因丢失的危险。6.对尼罗罗非鱼MyoD1基因SNP位点分析发现,296A→C多态性位点与雌性尼罗罗非鱼头长、体长显著相关(P<0.05),与雄性尼罗罗非鱼头长、体高显著相关(P<0.05),323T→C多态性位点与雌性尼罗罗非鱼体重显著相关(P<0.05)。7.对尼罗罗非鱼MyoD2、Myostatin、GH、IGF2 4个基因的SNP分析发现,4个基因的SNP位点均与尼罗罗非鱼的体重、体长、头长、体宽、体高等生长性状无显著的相关性(P>0.05)。本研究为今后借助分子标记对尼罗罗非鱼品种进行改良,选育出快长的新品系,从而缩短养殖周期,实现最大化的经济效益,并对实现罗非鱼重要经济性状优良基因的最佳组合和强化我国罗非鱼育种技术体系提供了分子遗传学参考。