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甘蔗是我国及全世界范围内最重要的糖料和能源植物。其成熟的茎秆中高达18%的蔗糖含量和高生物量,提供了全世界80%的总用糖量和40%的乙醇用量。作为C4类型光合作物,甘蔗利用典型的NADP-ME光合代谢途径高效地将光能转为化学能。在甘蔗中,碳水化合物(糖分)通过光合作用和固碳作用积累下来,这些糖类化合物在光合作用的“源”组织(蔗叶)中合成,运输并分配到非光合作用的“库”组织和器官(蔗茎等),为植物的生长发育提供必要的营养物质。SWEET(Sugars Will Eventually be Exported Transporter)是一种最新被定义的已糖和蔗糖转运蛋白家族,该家族成员在植物体内参与了多种生长发育过程,包括韧皮部糖分加载、花蜜分泌和花药开裂、加速病原感染植物等。针对甘蔗中SWEET基因家族的研究,将有利于理解糖分从“源”组织到“库”组织的运输系统及光合产物的分配过程,同时为培育甘蔗高生物量品种和抗性品种提供理论基础。为此,本研究对甘蔗SWEET基因家族关键成员的功能和调控进行分析研究,得到了以下结果:
(1)针对甘蔗SWEET基因家族中表达量较高的三个成员:SWEET13c,SWEET16a,SWEET16b,研究其糖转运相关功能。通过同源克隆获得全长编码序列,连接到过表达载体并转入BY.VW4000己糖转运缺陷型酵母中,结果表明:SsSWEET13c能够恢复缺陷型酵母转运糖的能力,但效果不明显;SsSWEET16a恢复了缺陷型酵母转运葡萄糖和果糖的能力;而SsSWEET16b在缺陷型酵母中则无明显恢复能力。将SsSWEET13c的编码序列克隆到植物过表达载体,并通过农杆菌转化到拟南芥,筛选至T3代获得目的基因纯合转基因植株。通过三引物法鉴定出T-DNA插入拟南芥SWEET13的纯合突变株。比较野生型(WT)、SWEET13纯合突变株(sweet13)、过表达SsSWWET13c拟南芥叶片中糖含量发现:相对野生型拟南芥,过表达SsSWEET13c导致拟南芥的叶片中蔗糖、葡萄糖、总可溶性糖含量明显减少,而突变株拟南芥糖含量变化不明显。此外,相对野生型拟南芥的根,过表达SsSWEET13c导致拟南芥的根显著增长、叶鲜重明显增大,而突变株无明显变化。
(2)在甘蔗割手密叶段发育转录组数据中,SWEET13c表达量呈现从叶基部至叶尖部逐渐升高的趋势;在昼夜节律的转录组数据中,SWEET13c表现为6:00至18:00表达量逐渐降低,18:00至次日4:00表达量逐渐升高。基于该基因表达背景,确定对SsSWEET13c展开进一步的调控表达研究,并对调控该基因的转录因子进行鉴定。通过构建SsSWEET13c的上游2000bp启动子区域的诱饵载体,进行酵母单杂交实验,测序鉴定到77个与SsSWEET13c互作的相关基因。对上述测序序列注释后,共鉴定到27个候选转录因子,来自MYB、bHLH、NF-YA、SRS、ERF、BBR-BPC1、FAR1、GATA、MADS1、Trihelix、Nin-like1、C3H、C2H2转录因子家族。
(3)基于酵母单杂交实验的结果,分析转录因子与SsSWEET13c在甘蔗叶段发育、昼夜节律和不同发育时期的表达模式,鉴定到6个对SsSWEET13c表达正调控的转录因子和10个对SsSWEET13c表达负调控的转录因子。针对上述具有正/负调控模式的转录因子进行一对一的酵母单杂交验证实验,最终成功验证了9个转录因子:BBR/BPC1、FAR11、FAR12、NF-YA1、MYB8、C2H22、SRS1、bHLH3、bHLH1。此外,通过构建SsSWEET13c的加权基因共表达网络,鉴定到31个与该基因共表达的转录调控因子,其中18个转录因子与酵母单杂交鉴定的转录因子来自相同转录因子家族,初步鉴定了SsSWEET13c的分子调控网络。
(1)针对甘蔗SWEET基因家族中表达量较高的三个成员:SWEET13c,SWEET16a,SWEET16b,研究其糖转运相关功能。通过同源克隆获得全长编码序列,连接到过表达载体并转入BY.VW4000己糖转运缺陷型酵母中,结果表明:SsSWEET13c能够恢复缺陷型酵母转运糖的能力,但效果不明显;SsSWEET16a恢复了缺陷型酵母转运葡萄糖和果糖的能力;而SsSWEET16b在缺陷型酵母中则无明显恢复能力。将SsSWEET13c的编码序列克隆到植物过表达载体,并通过农杆菌转化到拟南芥,筛选至T3代获得目的基因纯合转基因植株。通过三引物法鉴定出T-DNA插入拟南芥SWEET13的纯合突变株。比较野生型(WT)、SWEET13纯合突变株(sweet13)、过表达SsSWWET13c拟南芥叶片中糖含量发现:相对野生型拟南芥,过表达SsSWEET13c导致拟南芥的叶片中蔗糖、葡萄糖、总可溶性糖含量明显减少,而突变株拟南芥糖含量变化不明显。此外,相对野生型拟南芥的根,过表达SsSWEET13c导致拟南芥的根显著增长、叶鲜重明显增大,而突变株无明显变化。
(2)在甘蔗割手密叶段发育转录组数据中,SWEET13c表达量呈现从叶基部至叶尖部逐渐升高的趋势;在昼夜节律的转录组数据中,SWEET13c表现为6:00至18:00表达量逐渐降低,18:00至次日4:00表达量逐渐升高。基于该基因表达背景,确定对SsSWEET13c展开进一步的调控表达研究,并对调控该基因的转录因子进行鉴定。通过构建SsSWEET13c的上游2000bp启动子区域的诱饵载体,进行酵母单杂交实验,测序鉴定到77个与SsSWEET13c互作的相关基因。对上述测序序列注释后,共鉴定到27个候选转录因子,来自MYB、bHLH、NF-YA、SRS、ERF、BBR-BPC1、FAR1、GATA、MADS1、Trihelix、Nin-like1、C3H、C2H2转录因子家族。
(3)基于酵母单杂交实验的结果,分析转录因子与SsSWEET13c在甘蔗叶段发育、昼夜节律和不同发育时期的表达模式,鉴定到6个对SsSWEET13c表达正调控的转录因子和10个对SsSWEET13c表达负调控的转录因子。针对上述具有正/负调控模式的转录因子进行一对一的酵母单杂交验证实验,最终成功验证了9个转录因子:BBR/BPC1、FAR11、FAR12、NF-YA1、MYB8、C2H22、SRS1、bHLH3、bHLH1。此外,通过构建SsSWEET13c的加权基因共表达网络,鉴定到31个与该基因共表达的转录调控因子,其中18个转录因子与酵母单杂交鉴定的转录因子来自相同转录因子家族,初步鉴定了SsSWEET13c的分子调控网络。