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野猪(Sus Scrofa)是家猪的祖先，主要分布于亚洲、欧洲及非洲的大部分地区。本文首先对单拷贝核DNA标记(single copy nuclear DNA，scnDNA)在种群遗传学研究中的应用进行综述，然后分别基于SANDX-2序列变异和SLA-DQB第2外显子的PCR-SSCP带型，初步分析中国大陆地区野猪种群的遗传多样性，并对影响SLA-DQB进行SSCP分型的实验因素进行了优化。具体内容如下：
1、研究测定了89个中国野猪和1个家猪未知功能核基因SANDX-2位点的序列。序列比对后长510bp左右，发现有2处4种类型碱基缺失，30个位点发生碱基替换，共定义了19种单元型。在野猪中共发现18种单元型，其中7种只在某一地方种群中发现，11种为地方种群间共享单元型。用邻接法基于核苷酸Kimura2-parameter模型构建系统发生树中，19种单元型被明显分为2大支，但各枝得到的自展值均较低，且各亚种中出现的单元型散布在不同的进化枝中。结果表明SANDX-2位点的单元型在中国野猪中未形成明显的地理分布格局。若不考虑碱基的插入／缺失，用TCS构建19种单元型网络表明，单元型HAP2可能为一古老单元型，其他为衍生单元型。
2、研究优化了PCR-SSCP分型条件后，采用PCR-SSCP方法对中国野猪5个地方种群的41个个体的SLA-DQB外显子2进行分型。PCR-SSCP分型后共获得8个等位基因，发现15种标记带型，分别为AA、AB、BB、AC、AE、AH、BD、BF、BG、BH、DD、DG、DH、GG、EE。在鄂伦春地方种群中有6种带型，分别为AB，AE，AA，AC，EE和BB；红星地方种群中有4种带型，分别为AB，DH，BH和BB；古县地方种群中有3种带型，分别为AB，BB和AA；宝鸡地方种群有7种带型，分别为BB，BD，BF，BG，DG，GG和DD；金寨地方种群有3种带型，分别为AB，BH和AH。在8个等位基因中，等位基因B广泛分布在各个地理种群中。在中国野猪中，SLA-DQB外显子2等位基因的平均期望杂合度为0.6127，在各地方种群的平均期望杂合度在0.4444～0.7031之间。Hardy-Weinberg平衡分析表明SLA-DQB外显子2等位基因在野猪的5个地方种群中均未达平衡，这可能同该位点受平衡选择有关。地方种群问系统发生分析表明，鄂伦春种群和金寨种群彼此间的关系较近，红星种群、古县种群和宝鸡种群间的关系较近。