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本研究依据人和小鼠同源基因保守序列设计引物,扩增出猪NCOA1基因的部分序列,利用PCR-RFLP方法检测了正虹种猪场454头外来猪种(大白、长白和杜洛克)NCOA1基因的RsaI酶切多态性,并分析了其对母猪产仔性状的影响;同时对该片段进行了序列测定、同源性比较和聚类分析。主要研究结果如下: 1.通过PCR-RFLP基因型检测发现,长白猪和大白猪均存在三种基因型:AA、AB、BB,且AA基因型的频率远高于AB型和BB型;而在杜洛克猪群中只检测到AA基因型,没有检测到AB型和BB型。并且在整个猪群中,AA基因型频率为0.7455,远远高于其他两种基因型的频率;A等位基因的频率(0.8613)远远高于B等位基因的频率(0.1387)。 2.利用SAS统计软件分析猪NCOA1基因与产仔数的关系表明:NCOA1基因的RsaI酶切多态性对母猪产仔性状具有显著的影响,在总产仔数(TNB)和产活仔数(NBA)上都出现AA>AB>BB的趋势,基因型之间差异极显著(P<0.01)。如大白猪AA基因型的平均总产仔数和产活仔数分别比BB基因型高2.66头和1.57头,在长白猪中AA型比BB型分别高2.28头和2.07头。说明NCOA1基因对产仔性状有显著影响,A等位基因为优势有利基因。 3.在对母猪胎次与产仔数的关系进行分析发现,母猪胎次对其产仔数有显著影响,头胎总产仔数、产活仔数均低于经产胎次。经产胎次的平均产仔数显著高于头胎(P<0.01);而NCOA1各基因型的产仔数在经产胎次中的差异也是显著的,AA型的母猪总产仔数和产活仔数显著高于BB型母猪(P<0.01)。但是对于头胎产仔数,长白猪基因型之间差异不显著(P>0.05),而大白猪基因型之间差异显著(P<0.05)。 4.本研究还对猪NCOA1基因扩增片段进行了序列测定,片段长度为440bp,并发现了一个T/C突变,该突变导致RsaI酶切多态性,但没有引起编码氨基酸的改变,为沉默突变。 5.对不同物种之间该序列的同源性比较,发现该序列在各物种之间具有较高的保守性;利用UPGMA法对猪、人、小鼠、大鼠、鸡、狗、黑猩猩共七个物种