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我国是龙脑香科植物在亚洲分布的北缘，由于数量锐减，种群很小，大多数该科植物在我国被列为国家濒危保护物种。本研究采用ISSR(Inter-simplesequencerepeats)技术，对海南省4个地点的青梅种群进行了遗传多样性及其遗传结构进行分析，获得青梅种群分子遗传变异和遗传分化的数据，初步探讨影响其遗传变异水平和遗传分化的因素，揭示其种群受威胁的程度和原因，从而为青梅种群遗传资源的保护、利用提供理论依据。
采用14个ISSR引物对4个种群共130个个体进行PCR扩增，琼脂糖凝胶电泳检测到107条带，其中多态性带为90条，多态带百分率为84.11％，扩增条带片段大小在200bp～3000bp之间。同其它生活史特性相似的物种相比较，青梅的遗传多样性水平较高。青梅总的遗传多样性(HT)为0.262，种群平均遗传多样性(He)为0.228；Shannon信息指数(Ⅰ)在种群水平平均为0.348，Shannon信息指数(Ⅰ)物种水平上为0.416。4个种群中，万宁种群遗传变异较高(He：0.276；Ⅰ：0.417)。种群之间的遗传分化系数Gst为0.132，种群间的基因流(Nm)为1.638。分子方差分析(AMOVA)表明，青梅总遗传变异的84.09％存在于种群内，15.91％的遗传变异存在于种群间，符合龙脑香科植物遗传多样性主要存在种群内部的特点。上述研究表明，青梅种群具有较高的遗传多样性，并没有表现出濒危物种较低遗传多样性的特性，这与其种群大小、繁育系统以及传粉方式有关。但同分布于斯里兰卡和马来西亚的两个地方特有种相比偏低，暗示其遗传多样性的积累可能受到抑制。青梅种群遗传多样性主要存在于种群内，种群间出现中等程度的遗传分化。物种内较强的基因流，表明遗传漂变不是造成种群间遗传分化的主要原因，通过比较四个种群受扰动程度、湿度、降水、土壤条件的差异对种群间遗传多样性的影响，得出以上因素可能是造成种群间分化的主要原因。
针对人为扰动、生境破碎化可能是造成青梅种群致濒的原因，本文建议保护的重点应该是保护和恢复青梅种群的生境，促进天然林的更新，严禁乱砍乱伐。根据青梅种群内遗传多样性高于种群间遗传多样性的特点，可以采取原位保护的策略，在就地保护时应选取种群遗传多样性程度高，适宜其生长的集中分布区，建立自然保护区，如已建立的万宁礼纪青皮林保护区。由于青梅种群间出现一定程度的遗传分化，建议对种群内的个体进行植株相互移栽和采种育苗移栽，以提高种群间的基因交流，最大限度地保护其遗传多样性。对于坝王岭等遗传多样性相对较低的种群，说明这些种群的适应环境的能力较为脆弱，应该加大对这些地区种群的保护力度。