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生态安全评价研究是近年来新兴的一个研究领域，然而对于湖泊进行生态安全评价的研究还不多见。本论文在系统总结目前生态安全研究进展的基础上，针对湖泊复合生态系统构建了生态安全评价的概念模型，并建立了指标体系筛选、指标权重计算、生态安全总体评价及趋势分析的一系列方法，选择具有典型意义的太湖开展实证分析，并根据分析结果提出保障其生态安全的一些建议。
本文首先总结了生态安全的研究进展，包括不同视角的基本概念、评价的指标体系、评价标准、评价方法等多方面内容，指出其存在的问题及今后的发展趋势。基于此，对生态安全及相关概念进行了辨析，提出了本研究采用的生态安全概念。而后，建立了基于“驱动力-压力-状态-影响-响应”(DPSIR)模型的湖泊生态安全评价概念框架；通过指标可得性分析、原理分析和数学方法优选等3个步骤构建指标体系，其中数学方法优选通过相关性分析、主成分分析及层次聚类法检验等方法，以得到具有独立性和时间分异性的指标；并建立多准则群体决策模型以确定指标权重，最后利用加权平均法计算湖泊生态安全指数Ecological Security Index，并通过时间序列分析来研究湖泊生态安全的变化趋势、识别关键因子，以为保障湖泊生态安全提供决策依据。文章选取太湖进行了实证分析，首先对太湖目前的生态安全问题进行了剖析，重点对其水生态环境进行了分析；运用本文提出的湖泊生态安全评价方法，对太湖生态安全现状及发展趋势进行了研究。研究结果表明：太湖生态安全近年来呈下降趋势，2007年太湖生态安全评价结果为ESI=0.635，相比1980年代生态安全水平显著下降；在太湖生态安全各因素中，驱动力、压力、状态因素相比1980年代均呈下降趋势，而影响、响应因素略有上升，其中状态因素是影响生态安全的关键因子，其恶化与其驱动力、压力指标的下降密切相关。根据以上分析结果，提出应建立太湖生态安全的流域和谐发展模式、开展太湖生态系统修复工程、建立生态系统安全管理模式等建议。