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本文运用文献资料研究法、理论分析和比较鉴别法、历史研究和实证研究法、归纳演绎法等方法,采用问题导向的研究思路,总结了现阶段直属海事系统在财政管理制度建设、信息化建设、项目的绩效管理和绩效评价、预算管理改革等方面取得的成绩,分析了直属海事系统在预算管理、财力保障、非税收入征管、财政管理体制、财政监管等五个方面面临的突出问题或存在的不足,并针对面临的问题和存在的不足,提出了海事财政管理可遵循的改革模式,得出如下结论。(1)在财政预算改革方面,应实行“定员定额、零基预算”的分配方式；项目预算的改革重在科学的项目分类管理和竞争性资金分配机制的建立；改变传统的预算公开理念,采用合法适当的预算公开路径。(2)针对财力保障不足的缺陷,提出可以从改革船舶吨税分配机制、争取地方财力支持、加大后勤管理部门的资金保障力度、加大增收节支力度、发行海事发展债券筹集项目资金等方面着手,解决日常经费和项目经费存在的缺口。(3)探讨了“费改税”的可行性,提出从惠民生的角度出发,对港口建设费征收方式和征管模式进行改革。(4)分析直属海事系统财政管理体制有待完善的方面,提出在遵循相关法律法规的前提下,依据客观实际情况和业务量决定是否设置会计机构、决定会计人员数量的配置。提出理顺各级海事部门财政管理关系的思路。(5)提出可以从推进财政监管现场化和前沿化、运用网络信息化监管手段、改革内部审计管理体制、推行财务负责人委派制等四个方面来加强直属海事系统财政监管。