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科技创新体系是指科技资源组合的结构、方式、过程及相应的制度。科技创新体系的制度基础源于技术创新，表现为相关的制度体系。科技创新与制度创新的关系是作用与反作用的关系。好的制度可以降低创新活动的交易成本，创造合作条件，提供激励机制，还有利于创新利益的内部化。科技创新体系制度基础的建设目标之一就是要促进创新要素间的互动与合作。从构建制度环境层面看，就企业而言，包括构建明确的产权制度、良好的市场机制和相容的激励机制；就政府而言，包括有效的制度安排以及相关的支撑条件的构建。建构、完善和发展符合现代经济和科技发展规律的科技创新体系制度基础，对于培养科技创新人才，提高全民族的科技创新能力，实现我国经济的持续、快速、健康发展，以及全面建设小康社会都具有重大的现实意义和理论意义。本文首先简要概括和总结国外几个国家建设科技创新体系制度基础的经验，并对这些经验进行了小结，以便我们学习、借鉴。其次，回顾了我国科技创新体系制度基础的建构、发展状况，指出目前我国科技创新体系制度基础建设尚存的若干不足或缺陷，特别是制度问题，并从科技体制、经济体制和环境氛围等方面分析了产生这些问题的原因。第三，在借鉴国外经验的基础上，结合我国科技创新体系制度基础建设的实际，提出了一个关于我国科技创新体系有效运行的制度基础的构想。最后，文章从重塑科技创新主体、完善体制机制、宏观制度安排以及营造有利于科技创新的良好环境氛围、创造支撑条件等几个方面进一步提出了加快构建我国科技创新体系制度基础的对策。