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新型农村合作医疗制度是由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。随着传统合作医疗的解体，农村卫生事业的投入严重不足，医疗卫生资源城乡分配不平衡，农村医疗卫生体制改革严重滞后，农村卫生状况、农民健康状况堪忧。农民因病致贫、因病返贫的问题显现。 根据实地调查新型农村合作医疗制度的实际运行情况，了解参合农民的满意度，发现目前新型农村合作医疗在实际运行中还存在哪些具体的问题，进而有针对性地完善新型农村合作医疗制度，是防止农民因病致贫、因病返贫和全面建设社会主义新农村的需要。 重庆市从2003年开始启动新型农村合作医疗试点工作。本文通过对重庆市綦江县新型农村合作医疗制度进行实地调查，了解当地的地理环境、人口经济情况及医疗卫生发展状况，对新型农村合作医疗制度的变化发展、运行情况和农民的满意程度进行了一定的梳理和总结，并从农民、医疗卫生部门和政府三个角度对新型农村合作医疗制度存在的问题进行分析。针对存在的问题，笔者提出了优化对新型农村合作医疗的宣传引导工作、建立科学稳定的筹资机制、加强对定点医疗机构的监管、加强对合作医疗基金的监管和加强各级经办管理机构的人员队伍建设等几点思考和建议，以期得到当地相关部门的重视并予以有效解决，促进西部地区新型农村合作医疗制度的完善，更好地保障参合农民的利益和促进农村医疗卫生事业的健康发展。