【摘 要】
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"髓茎稻"是籼稻栽培种"双科早"经γ射线诱变后得到的一个突变体,与野生型相比,它的主要特点是,茎秆最上节间多出了一些厚壁细胞组织,叶色变深,它的株形更加直立紧凑.因此初步
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"髓茎稻"是籼稻栽培种"双科早"经γ射线诱变后得到的一个突变体,与野生型相比,它的主要特点是,茎秆最上节间多出了一些厚壁细胞组织,叶色变深,它的株形更加直立紧凑.因此初步定名为髓茎填充突变体(pith stuff 1.ps1),为了分离与这一突变相关的基因(PS1)和研究这一基因的结构与功能,该实验在进一步分析这一突变体的形态解剖学及遗传学特征的基础上,对该基因进行了精细定位.主要工作如下:1、将此突变体与野生型回交,所得F1代的表现均与野生型相似,在F2代出现分离,野生型和突变体接近3:1的分离比,表明ps1突变为单基因隐性突变.2、为了选择合适的亲本构建作图群体,该研究比较了"ps1"和几种亲本间的多态性,在236个标记中,在"ps1"和"中花11"之间存在多态的标记有119个,占总数的50.42％,它们覆盖水稻整个染色体组约1685.2CM,平均间距14.16 CM.而"ps1"和"Kasa"、"TSA"、"P<,188>"、"P<,42>"之间的多态性分别为45.33％、21.18％、44.49％、22.45％,所以我们选择"中花11"作为父本用于后续研究.3、为了通过图位克隆的方法分离PS1基因,我们把ps1与"中花11"杂交,构建了相应的作图群体,在总共12300株F<,2>个体中,总共采集2245株隐性个体,在其中挑取94株作为初步定位群体,发现PS1和定位在第10染色体上的标记SSR1连锁,连锁距离为2.7CM,因此PS1基因初步定位在10号染色体上.4、为了进一步精确定位PS1区域,我们通过两个数据库的比对(http://rgp.dna.affrc.go.jp和http://btn.genomics.org.cn/rice),设计了13个新的标记(P<,1-1>-P<,3-2>),这几个标记间的平均间距约32kb.选取所有隐性个体作为精细定位群体,我们将PS1精细定位在标记p1-5和p3-6之间,物理距离大约290kb.在这段区域内有3个PAC克隆,43个开放阅读框,我们用RT-PCR的方法扩增出了其中一个开放阅读框的eDNA并测序.相信通过对PS1的研究将有助于我们对单子叶植物茎的发育有更深入的了解.
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