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毕赤酵母作为一种广泛使用的模式菌株,对于食品、医药及工业生产都具有重要意义。目前对毕赤酵母GS115编码基因的研究较为深入和广泛,但是对于毕赤酵母lncRNA的研究还处于初级阶段。lncRNA是一类不具有编码功能,长度大于200 bp的RNA,在真核生物中普遍存在,且具有调控作用。本研究以高产磷脂酶A2毕赤酵母GS115作为研究对象,利用RNA-Seq技术进行转录组检测,通过生物信息学技术预测lncRNA,预测lncRNA可能作用的靶基因及相关功能。通过改变lncRNA的转录水平,探究lncRNA的功能。主要研究成果如下:预测得到208个lncRNA,并通过荧光定量PCR验证了数据的可靠性。比较了毕赤酵母中lncRNA与mRNA的长度、开放阅读框长度、转录水平、内含子个数。通过对甲醇与甘油相以及不同外源表达水平样本中的lncRNA转录水平的比较,得到39个样本间显著差异的lncRNA。从顺式作用和反式作用两个方面对显著差异lncRNA进行功能预测。顺式作用:1、预测反义lncRNA对正义链mRNA的作用。得到TCONS00002848、TCONS00003442、TCONS00004115等可能作用于其正义链mRNA。2、对显著差异lncRNA上下游10k的顺式作用靶基因进行富集。甲醇相与甘油相显著差异lncRNA共有18个,顺式作用靶基因共有206个,富集到多个与蛋白质代谢、细胞修复以及能量代谢相关的途径。不同外源蛋白表达水平样本中显著差异lncRNA共30个,顺式调控靶基因共有327个,富集到多个与蛋白质合成、压力响应以及细胞周期相关途径。反式作用:预测到18个甲醇相与甘油相显著差异lncRNA的846个反式调节靶基因,富集到多个与大分子代谢、压力响应、能量代谢有关的途径。预测到30个不同外源蛋白表达水平样本中显著差异lncRNA的757个反式作用靶基因,富集到多个与蛋白质合成、压力响应、能量代谢有关的途径。通过改变lncRNA的表达水平,验证lncRNA的功能。发酵结果显示,lncRNA的敲除并没有造成其表型上的变化。荧光定量PCR结果显示,在对TCONS00004115 lncRNA进行了敲除以后,其部分预测的与信号传导靶基因的表达量出现了明显的改变。TCONS00004115 lncRNA过表达以后,其部分与RNA聚合酶调控、氧化压力响应相关靶基因在转录水平出现了较为明显的变化。