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中药指纹图谱是目前能够为国内外广泛接受的一种中药质量评价模式。作为中药质量控制方法，国内外对指纹图谱的研究尚属起步阶段。本论文以中药复方注射液为研究对象，主要利用色谱方法，研究了中药复方指纹图谱的获取方法及其优化过程，并考察和评价了方法的专属性和稳定性。利用相似性比较的方式，从整体角度考察了结果的稳定性，并结合一定的聚类方式，抽取其中的特征信息，用于质量控制、全过程质量评价和新药开发。
论文在引言中对中药研究的现况作了综述，并对中药现代化关键问题进行了分析。在此基础上，主要针对复方展开了讨论，提出了指纹图谱的研究方法论和主要研究内容。
在指纹图谱获取方法研究中，选取痛必定和清开灵两个典型复方注射液进行了方法摸索和研究。研究过程主要针对复杂样品体系的分离分析方法和途径进行了重点探讨，结果说明过程指标的相对模糊化，分析目标的实时调整是复杂样品体系分析的主要特征。
指纹图谱的评价研究中，对方法的专属性、准确度、精密度、稳定性以及耐用性进行了系统考察，结果表明指纹图谱测定中，实验体系条件对测定结果的影响远远复杂于一般分析测定体系，但对主要影响因素进行控制后，完全可以得到稳定重复的指纹图谱。
指纹图谱获得的物质信息经过归类可以分为一般信息和特征信息，通过有关样品间的指纹图谱特征信息的相关性分析和比较，可以用于质量控制、全过程质量评价和新药开发，论文分别以痛必定和清开灵为例，进行了以上三方面的研究，研究结果表明指纹图谱可以用于中药质量评价和中药新药的开发。