脊髓小脑共济失调症6型(SCA6)的比较基因组学研究

来源 :中国科学院遗传与发育生物学研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lcp396526202
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脊髓小脑性共济失调症(spinocerebellarataxiaSCA)是常染色体显性共济失调症(autosomaldominantcerebellaataxiaADCA)的一种,是由于CAG重复的过度扩增造成的。本研究选取脊髓小脑共济失调症6型(SCA6)作为研究对象,该型特点在于发生扩增的CAG重复位于CACNA1A基因内部,当重复数目超过20就会引起发病。我们扩大灵长目动物的研究范围,涉及了从原猴到人类的整个进化图谱中的共28种30个不同的样本,对这些样本进行比较基因组学的研究。本研究的目的是以进化的方法了解CAG重复扩增在不同灵长目动物中的动态演变规律。通过PCR,电泳及T/A克隆获得所有目的产物,对这些产物进行测序,使用Clustalx1.81对所得序列结果进行比对。使用mfold3.1对mRNA的结构进行预测。我们的研究结果发现随着新世界猴到人类的进化过程,CAG重复的数目存在递增的趋势,此外,在原猴与新世界猴之间发生了CAG重复数目的骤减,并且在原猴的CAG重复内部或边缘有CAA的插入。对人类没有CAA间隔的重复序列区域与原猴有CAA间隔的重复序列区域的mRNA结构比较发现,人类的CAG重复区域形成的单一的发夹结构,而后两者中则不会形成单一的发夹结构。综上我们得到结论:在灵长目中,从新世界猴到人类的进化过程中,CAG重复的数目存在一个逐渐增加的趋势,也就是在人类中CAG重复的数目更容易发生异常的病理扩增;而在原猴中出现的CAG数目的骤增以及CAA插入的出现,恰恰阻止了原猴发生与人类一样的异常扩增的可能。
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