基于药物靶标三维结构的虚拟组合集中库程序设计及其应用

来源 :中国科学院上海药物研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yu19910108
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组合化学为发现新的药物先导化合物提供了大量候选化合物,但它是一种高成本、低利用率的方法.集中库的出现和虚拟筛选的方法使组合化学扬长避短,成为一种更实用的药物研究方法.将组合化学和合理药物设计结合起来,在合成组合库之前,通过分子模拟和理论计算方法合理地设计虚拟化合物库,可以增加库中化合物的多样性和类药性,提高库的质量和筛选效率.在该论文中,我们编写了基于药物靶标三维结构的组合集中库设计程序,并将其应用于有关PPARγ和COX-2的药物研究.通过分子对接方法我们确定了这些分子与EGFR的结合方式和相互作用.根据结合构象,我们得到了可靠的CoMFA和CoMSIA模型,两个模型的立体场、静电场相当吻合,CoMSIA模型的疏水场分布与EGFR的空间结构和性质相匹配.这些结果为进一步的药物设计奠定了良好的基础.
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