骨化相关基因单核苷酸多态性与强直性脊柱炎的相关性分析

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强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)是一种慢性炎症性自身免疫性疾病,以骶髂关节和脊柱关节的慢性进行性炎症表现为主,并最终导致受累部位骨性强直。遗传因素在AS的致病机制中发挥重要作用,HLA-B27一直是AS疾病相关性遗传标记的最好例证。对AS的全基因组扫描研究不仅证实了HLA区域是与AS相关的重要区域,并且发现了HLA区域外还存在其他的AS易感区域。通过前期对国内外有关AS易感区域的Meta分析进行汇总,我们发现6p22.3-p21.1为AS最显著连锁区域,6pter-p22.3、3p22.1-p14.1、16q23.1-qter为热点区域。此外,16q12.2-q23.1、6p21.1-q15、10q23.33-q26.13、17pter-p12、2p12-q22.1、2q34-q35、5q34-qter、2p23.2-p16.2、11pter-p15.1、9q31.1-q33.3等区域也与AS存在连锁,这些区域最可能含有AS的易感基因。目前,对强直性脊柱炎易感基因的研究仍主要集中于炎症方面,仅少数研究是与钙化和/或异位骨化相关。新骨形成是AS发展中的一个主要过程,AS患者往往表现出明显的异位骨化现象。异位骨化主要受WNT、BMP等信号通路的调节,这些信号通路上位于易感区域的骨化相关因子极有可能为AS的骨化相关易感基因。本实验室首次提出了AS可能存在骨化相关的易感基因,并证实了LRP5基因的一个新的SNP位点(c.4488+74G> A)与AS相关。本研究在此基础上,对其他骨化相关基因进行了筛选。研究内容主要分为两部分:第一部分通过taqMan探针法对WNT5A、RHOA和MSX2这三个位于易感区域并与骨化相关的信号通路基因的6个tagSNP进行基因分型,分析其是否为AS骨化相关易感基因。第二部分通过多重Snapshot分型技术对ANKH和TNAP两个骨化相关基因的9个SNP位点进行基因分型,分析其是否为AS骨化相关易感基因。目的:通过对WNT5A、RHOA、MSX2、ANKH和TNAP这5个骨化相关基因多态性的研究,分析其SNP位点等位基因∕基因型与强直性脊柱炎之间的关联性,证明其是否为强直性脊柱炎易感基因。方法:本研究采用“病例-对照”的方法,taqMan探针法基因分型实验对象包括336例强直性脊柱炎患者以及336例健康人群作为对照。多重Snapshot法基因分型实验对象包括278例强直性脊柱炎患者以及286例健康人群作为对照。利用SHEsis、 Haploview4.0、 Plink及SPSS16.0等软件进行统计学分析。Hardy-Weinberg平衡分析、基因型和等位基因频率分析通过SHEsis-online在线软件;采用χ2检验的方法,计算SNP位点等位基因和基因型频率的差异;P<0.05为结果有统计学意义;利用SHEsis软件进行多重检验校正,permutations设为10,000;利用Haploview4.0进行连锁不平衡(LD)分析、单体型(haplotype)分析等。结果:(1)多重Snapshot方法分型结果ANKH基因rs26307位点基因型频率和等位基因频率分布在AS组和对照组中存在显著差异(genotype permutated p=0.00481, allele permutated p=0.0126),rs27356位点基因型频率和等位基因频率在AS组和对照组中存在边缘差异(genotype permutated p=0.055, allele permutated p=0.0596)。rs26307位点T等位基因(OR=0.634,95%CI=0.475-0.847)明显的降低了发展为AS的风险性。ANKH单体型分析显示rs26307(C)/rs27356(T)单体型为AS的诱发因素(OR=1.53,95%CI=1.165-2.071, permutation10000corrected p=0.0103);rs26307(T)/rs27356(C)单体型为AS的保护因素(OR=0.659,95%CI=0.487-0.890, permutation10000corrected p=0.0264)。(2) TaqMan探针法分型结果WNT5A基因rs472631位点基因型频率和等位基因频率分布在AS组与对照组中有统计学差异(genotype permutated p=0.029, allele permutated p=0.016)。进一步分析可知T等位基因为风险等位基因,C>T突变增加了AS的患病风险。WNT5A基因单体型分析结果显示rs472631(C)/rs11918967(C)单体型为AS的保护因素(OR=0.722,95%CI=0.567~0.918, permutation10000corrected p=0.008);rs472631(T)/rs11918967(G)单体型为AS的诱发因素(OR=1.304,95%CI=1.001-1.700, permutation10000corrected p=0.049)结论:本研究发现WNT5A基因rs472631位点和ANKH基因rs26307位点多态性与AS易感性相关。由此可以说明WNT5A和ANKH基因可能是参与AS易感性的骨化相关基因。
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