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作为二十世纪的现代知识分子，面对西方价值观念的冲击，例如自由、民主、科学等，不能不作出自己的回应，反思这些价值观念的同时，不能不考虑如何在中国实现这些价值，也就是如何完成中国现代化的问题。这其中当然就必须涉及到这些价值与中国传统价值之间的关系问题。对这一关系的不同认识，成为了分别此后各个思潮的主要依据。作为当代新儒家的牟宗三，同样面临着这一问题:如何完成中国的现代化。可以说，现实的关注始终是牟宗三哲学思考的出发点以及归宿。如果不了解这一点，则无法完全理解牟宗三以及当代新儒家的工作，而他们也就与传统的儒者无以异。牟宗三终其一生呼唤自由、为自由呐喊，为实现中国的自由民主倾尽心力。如果不考虑到这一点，即牟宗三对科学、民主、自由等现实问题的关怀，则其对中国传统哲学的疏解以及建立自己庞大的哲学体系就不能获得充分理解。正以此之故，本文关注牟宗三的自由观问题，藉以对此问题做深入的分析，摸清其中的去脉来龙以及在牟宗三哲学思想中的地位，俾使对牟宗三哲学定位有所助益。
基于以上的分析，绪论部分首先考察牟宗三哲学思想在现阶段研究的局限，从一个侧面可以证实笔者前面的意见，进而分析牟宗三关注，乃至于终其一生论说自由主义的原因，也就是他关注自由的动机何在。这个问题弄清楚了，才能继续后面的讨论。
第一章从总体上介绍、分析牟宗三对自由、自由主义以及怎样做一个真正的自由人的论述，这其中也涉及到牟宗三论述自由的背景、主体自由的型态、以及自由的基础等问题。而在牟宗三讨论自由主义的时候，涉及到他对西方自由主义发展到近代以及自由主义在中国传播所出现的弊病的批评。在这个基础上，牟氏最后给出他关于自由主义以及如何做一个自由人的真切涵义。
第二章在第一章的基础上，从道德与政治两个方面对牟宗三自由思想进行分析和诠释。这部分也是本论文的核心所在。首先从道德方面考察牟宗三自由观的涵义，以及与近代自由主义者所讨论的积极自由的关系;然后从政治方面考察牟宗三自由观的涵义，以及与消极自由的关系。最后考察环绕此一问题学界所产生的争论，并试着从“体”、“用”关系来理解牟宗三的自由思想。
第三章在前文的基础上讨论牟宗三自由观中道德与政治的关系。第二章主要是静态地考察两者之间的逻辑关系，而这一章的目的则在于从道德到政治如何过渡的问题。也就是牟氏著名的命题:“内圣开出新外王”的问题。这里就牵涉到何谓“新外王”？“内圣如何开出新外王”？开出的理论依据何在？及与另一命题“良知自我坎陷”说的关系何在？这些都是本章所要讨论的。最后则涉及对于这一问题学界的争论以及批判。
最后是结语部分。基于以上各章的分析，结语部分则试图从作为一个自由主义者的角度对牟宗三进行阐述，以回应绪论部分的预设。