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80年代初以来席卷全球的行政改革，发出了评价政府绩效、减少和优化政府职能的普遍呼声。许多国家都以评估政府绩效作为政府改革的一个重要组成部分，以用来提高政府效率和服务质量。政府绩效审计是政府审计发展的历史必然，是政府受托经济责任发展到一定阶段的必然结果。由于绩效审计反映了时代的要求，世界上许多国家的政府审计部门都积极开展这一审计形式。绩效审计目前已成为许多国家政府审计关注的焦点和主要工作内容。而我国审计机关以往的工作都是以财务审计为中心的，仅在一些审计项目中涉及到绩效审计的部分内容。近年来我国审计机关也开始重视绩效审计，国家审计署提出：要积极开展绩效审计，逐年加大绩效审计分量，到2007年，投入绩效审计的力量占整个政府审计力量的一半左右。效益审计以揭露管理不善、决策失误造成的严重损失浪费和国有资产流失为重点，促进提高财政资金管理水平和使用效益，维护国有资产安全。在《2008至2012年审计工作发展规划》中明确提出全面推进绩效审计，积极探索全过程跟踪审计。目前，审计署和各级审计机关都在积极探索政府资金全过程绩效审计。由此可以看出，我国政府财政资金全过程绩效审计在近几年会得到较快发展。
但我国当前的政府绩效审计理论研究明显滞后于实践的发展，突出表现在：理论研究及研究成果缺乏系统性；对方法、手段、目的等实务问题研究不足；研究方向多针对企业效益审计，对政府部门的绩效审计研究较少，对政府部门的全过程绩效审计研究更少等等。针对这些问题，本文在深入分析政府绩效审计产生的历史背景及根本原因的基础之上，借鉴绩效审计先进国家的理论研究成果和实践经验，结合当前我国开展绩效审计所面临的实际情况，重点研究项目全过程绩效审计，并将项目投资分专项资金支出和基本建设投资项目支出两种情形进行阐述，提出适用于我国目前审计环境的绩效审计基本理论，并在理论的指导下，将全过程绩效审计分为事前审查，事中控制，事后评价，尝试探讨我国当前开展政府资金全过程绩效审计亟待解决的几个实务问题：即政府资金全过程绩效审计方法问题、绩效审计模式问题和绩效审计标准的建立和选用等问题。政府资金全过程绩效审计的理论研究和实务探索是一项艰巨的任务，需要社会各界的支持和参与，本文只是尽自己所能对政府财政资金全过程绩效审计的某些问题加以研究和分析，并提出自己的观点，希望对我国政府财政资金全过程绩效审计的开展提供一定的帮助。