【摘 要】
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小反刍兽疫（PPR）是由小反刍兽疫病毒（PPRV）引起的绵羊和山羊的高度传染性疾病。2007年我国在西藏的阿里地区首次发现该病,2013年末该病再次传入我国新疆地区并快速传播至22个省份
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小反刍兽疫（PPR）是由小反刍兽疫病毒（PPRV）引起的绵羊和山羊的高度传染性疾病。2007年我国在西藏的阿里地区首次发现该病,2013年末该病再次传入我国新疆地区并快速传播至22个省份。该病对我国养羊业危害巨大。为了解我国20142017年间PPRV毒株的分子流行特征,我们利用二代测序技术对我国20142017年间收集的28株PPRV毒株进行基因组序列测定,与我国20132014年间的25株PPRV毒株基因组序列进行比较,用MEGA 6软件对测定的核苷酸序列和推测的氨基酸序列进行比较分析,绘制系统发生树,采用BEAST软件包进行分子进化分析。我国20142017年间PPRV毒株基因组长度均为15954nt,其核苷酸同源性为99.7%100%。毒株间核苷酸差异位点为518个,氨基酸差异位点为137个,变异最大的为H基因。20132017年间我国PPRV进化速率为2.69×10-6变异/位点/天(95%HPD为2.29×10-63.04×10-6变异/位点/天),即9.81×10-4变异/位点/年(95%HPD为8.37×10-41.11×10-3变异/位点/年)。20132017年间的53株PPRV毒株来源于一个共同起源,TMRCA（最近共同祖先）为2013年7月。20132017年间的53株PPRV毒株分为5个进化分支,其中3个分支为优势进化分支。毒株间不存在时间和地域分布差异。被PPRV感染的动物种群数量在2014年1月至2014年4月出现快速增长,2014年8月后进入平台期。本研究揭示了我国PPRV病毒分子流行病学特性,对于该病的防控具有重要的参考价值。
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