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目的:应用计算机模拟方法预测不同种类的黄酮类化合物对CYP2D6亚型的影响并通过大鼠体内药物抑制实验进行验证。
方法:1.计算机分子相似度计算:我们搜集了典型的四大类黄酮化合物分别是黄酮和黄酮醇类,二氢黄酮和二氢黄酮醇类,异黄酮类以及黄烷类,每个类别10个化合物。我们应用ChemDraw软件保留其取代基结构,替换其分子骨架。应用网站Online SMILES Translator and Structure File Generator得到每个化合物的PDB文件,并通过Pubmed数据库得到其相应的SMILES字符串。应用Cytoscape软件中的Chemviz插件计算分子相似度,应用Z值评价每种化合物与已知的CYP2D6抑制剂的结构相似度。2.计算机分子模拟:从Protein data bank上得到CYP2D6的分子结构及其活性中心位置,应用软件Autodock4.2将其与已搜集的CYP2D6抑制剂小分子进行对接,与实验得到的Ki转换为pKi值对比计算准确度;并模拟药物体内代谢过程,将四类黄酮化合物分别与CYP2D6蛋白分子对接,得到Ki值,比较四个类别化合物的pKi值。3.大鼠体内药物抑制实验验证:实验分为5组:空白组(美托洛尔组)、水飞蓟提取物十美托洛尔组、银杏叶提取物+美托洛尔组、葡萄籽提取物+美托洛尔组以及大豆提取物+美托洛尔组。给药后测定大鼠心率、收缩压、舒张压以及平均血压;应用高效液相色谱法测定美托洛尔血药浓度。
结果:计算机分子相似度结果表明异黄酮类化合物与已知CYP2D6抑制剂结构相似度显著小于其他三组(p<0.01);分子模拟结果表明异黄酮类化合物对CYP2D6抑制相比其他三类别提取物较轻微(p<0.001)。异黄酮提取物对同时给予的β受体阻断剂美托洛尔的降压效果没有影响,与其他三组有显著差异(p<0.05);应用高效液相色谱法测定其血药浓度,结果显示大豆提取物组与空白对照组无差别(p>0.05),与其他三组有显著性差异(p<0.001)。
结论:异黄酮类化合物对CYP2D6影响较小,分子计算与体内实验方法相结合将有助于整体评价含有多种化学成分的植物提取物对CYP450代谢活性的影响。