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在已完成全基因组测序的40株杆状病毒基因组中均包含29个基因,它们被称为杆状病毒核心基因。由于helicase,ac96,38K和够5四个核心基因在各个病毒基因组排列在一起,且基因的转录方向保守,从而组成杆状病毒核心基因簇。本研究通过比较其它核心基因在各个病毒基因组中的相对位置(gene order),发现gp41,αc81,vp91/p95和vp39,,lef-4,αc92在所有的鳞翅目昆虫杆状病毒基因组中都成簇排列。本文对这些基因簇的精细结构进行了描述。
先前的研究表明苜蓿银纹夜蛾核多角体病毒(Autographa californicamultiple nucleopolyhedrovirus AcMNPV)的38K基因与其核衣壳的装配有关,并且是AcMNPV复制所必需的,但其作用方式尚未明确。38K同源物的氨基酸多序列比对显示羧基端区域较保守。InterProScan搜索发现38K蛋白具有HAD超家族的特征,可能编码一种丝氨酸蛋白磷酸酶。利用。PCR法扩增得到38K的全长基因,克隆至表达载体pPROEX HTa,转化至大肠杆菌DH5α。经IPTG诱导,融合蛋白以包涵体形式表达,表达蛋白的相对分子量约为41kD。利用6×His-tag表达和纯化试剂盒,获得纯化的融合蛋白。利用丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶检测试剂盒未能检测到该融合蛋白具有磷酸酶活性,推测来源于包涵体的38K蛋白没有酶活性。