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伴随全球化和信息化的发展，单体独立创新已经难以满足经济社会的发展需求，创新主体间跨区域合作创新已经成为一种常态，针对区域间协同创新关系的创新网络研究逐渐受到重视。正确认识区域间协同创新关系是合理调整创新资源分布的前提，而近年来学术界对于协同创新网络的研究依然集中于创新主体间的协同创新。在区域关系研究领域，从泰勒的世界城市网络研究开始，各种资金流、客运流、信息流均被运用于城市网络研究领域，却没有对知识流给予足够重视，区域间创新关系研究已经成为区域经济学和经济地理学研究的重要任务之一。 企业已成为创新的第一大主体，诸多学者提出应该立足于企业间创新关系来了解区域间协同创新的本质，但目前为止鲜有学者基于企业视角来研究区域协同创新网络，宏观属性数据依然是刻画区域协同创新网络的常见媒介。另外，迫于数据和方法限制，学术界对于区域协同创新网络的演化规律和效应研究也比较少。因此，论文在总结回顾现有产学研协同创新理论、流动空间理论等相关理论研究的基础上，构建企业组织关系塑造区域协同创新网络的理论框架。接着基于ESDA空间分析方法找出区域协同创新存在的证据和空间关联模式。然后利用企业组织关系对1304家制造业上市公司的创新产出进行空间地理加权，刻画区域协同创新网络，运用社会网络分析法系统分析了我国区域协同创新网络演化的整体特征、区域个体特征以及层次特征。最后，论文从结构视角构建模型实证探讨了区域协同创新网络对于区域创新能力增长以及区域经济增长的影响。研究发现:(1)区域创新能力呈现出东强西弱的基本特征，创新资源的空间溢出是区域间协同创新存在的直接证据;(2)中国区域协同创新网络格局由“交叉扇形结构”演化为“菱形结构”，区域协同创新网络是多中心地等级网络交织的结果，且网络密度呈现匀速上升趋势;(3)上海、江苏、安徽共同构成了创新资源集聚的三核结构，广东是我国创新资源辐射能力最强的省市，四川在构建东西部协同创新联系过程中发挥重要中介作用;(4)网络密度最大的凝聚子群由“南北布局”演化为“东西布局”，这与产业由东向西转移密切相关，组织邻近性促成了大范围、远距离协同创新现象。(5)创新资源流动的中介能力对区域短期创新能力增长发挥主要作用，而区域长期创新能力增长则主要依赖于创新资源的溢入水平。(6)创新资源内部流动是区域内协同创新驱动本地经济增长的直接途径，创新资源的溢出是创新资源富足地区利用逆向溢出机制促进经济增长的重要方式，创新资源的溢入是创新资源贫瘠地区逐步缩减与发达地区经济差距的主要手段。