【摘 要】
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该论文工作的核心内容是发展基于结构的药物设计方法.作者以发展全新药物设计方 法为重点,主要进行了三个方面的工作:一、发展出了一种新的预测配体分子与蛋白 受体亲和性的
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该论文工作的核心内容是发展基于结构的药物设计方法.作者以发展全新药物设计方 法为重点,主要进行了三个方面的工作:一、发展出了一种新的预测配体分子与蛋白 受体亲和性的方法SCORE.作者把配体与受体结合过程的自由能变化分解为若干能量因素,并用线性的经验方程来表示这一关系.SCORE可以根据配体-蛋白受体复合物的三维结构,计算得出复合物的解离常数.二、编制了全新药物设计程序包括LigBuilder .该程序包可以对靶蛋白的结合部位进行分析,推导出关键的结合位点,并利用片段 为基本单位在结合部位中进行配体分子的自动构建和筛选.LigBuilder既可以用于全 新先导化合物的发现,也可以用于已知先导化合物的优化,还可以与数据库搜索法联 合使用,是进行基于结构的约物设计的实用工具.三、发展出了一种计算有机化合物 脂水分配系数的新方法XLOGP.XLOGP采用原子加合法,共使用了80种基本的原子类型 以及5种修正因子.该方法可以根据化合物的拓扑结构计算出它的脂水分配系数,计算的结果还可以产生分子疏水场,用于三维定量构效关系研究.
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