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科研单位的财务管理在长期的实践中,初步形成了比较完整规范的会计理论和方法体系,但在具体应用上还没有真正体现内部会计控制的作用。随着社会主义市场经济的发展和经济体制改革的深入,尽快建立起以会计为中心,覆盖科研、经营、管理等方面的内部会计控制体系已经成为当务之急。本文首先从内部控制和内部会计控制的含义与范围入手,分析构建企业内部会计控制的理论依据,指出了企业内部会计控制在内部控制体系中的核心地位。然后从内部会计控制理论出发,通过对S研究院现行的组织机构和内部会计控制状况进行分析,找出其内部会计控制方面存在的问题。在此分析的基础上,依据企业构建内部会计控制框架的原则,设计了S研究院的内部会计控制框架。并以优化控制环境和有效控制的方法为重点,研究了其如何进行内部会计控制。本文根据S研究院的现状,设计了内部会计控制的框架,重点对控制环境和控制活动两个要素进行研究,改进了S研究院的财务组织机构,明确界定了各岗位人员的权责,理顺了沟通渠道,并运用会计系统控制和预算控制的方法,进行内部会计控制活动,使会计控制突破了传统会计滞后的事后控制,强化了会计控制职能中的事前控制和事中控制。本文是以解决实际问题的方式,研究有关内部会计控制的理论,笔者认为这种以实际问题来探讨的方式方法,更有利于深化理论研究,并能够真正解决实际问题。本文希望通过对内部会计控制理论和科研单位实际运作相结合进行具体分析和探讨,对科研单位内部会计控制制度的建立、健全以及实施能够有些许的意义,以不断完善科研单位的内部会计控制体系。