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以全氟辛基磺酸和全氟辛酸为代表的全氟化合物作为表面活性剂被广泛使用，目前全氟辛基磺酸和全氟辛酸作为受广泛关注的全球性的环境污染物，对其环境问题的研究已经成为当前环境科学的一大热点，而我国对全氟辛基磺酸和全氟辛酸的分析方法和污染调查研究以及它们的毒性作用机理的研究才刚刚起步。
本文建立了利用高效液相-四级杆/飞行时间串联质谱分析全氟辛基磺酸及全氟辛酸的方法，该方法的优点是分析物的指认准确，不易产生假阳性结果，检出限可达到0.5ng/g。然后采用建立的分析方法，分析了来自我国22个城市的25个污水处理厂的活性污泥样品中的全氟辛基磺酸及全氟辛酸。结果显示，全氟辛基磺酸的含量在6-700ng/g，全氟辛酸含量在4-156ng/g。
针对全氟辛基磺酸和全氟辛酸在环境介质中浓度低的特点，在检测时需要提高富集倍数，为了解决这个问题，本论文建立了利用中空纤维支载液膜萃取活性污泥中全氟辛基磺酸和全氟辛酸的方法。该方法将Aliquat-336溶于二己基醚作为萃取剂，溴化铵作为接受相，全氟辛基磺酸的富集因子达到20，对全氟辛酸的富集因子达到10，提高了方法检测的灵敏度，并使用此方法分析了加标样品，回收率达到要求。
接着，用固相萃取-高效液相-三重四级杆飞行时间质谱对给我国25个活性污泥样品中的9种全氟化合物进行了分析。并对活性污泥中重金属浓度及总有机碳含量进行了分析。结果表明，目前我国活性污泥中全氟化合物的污染物主要是全氟辛基磺酸和全氟辛酸。在采自厦门的一个活性污泥样品中除检测出全氟辛基磺酸和全氟辛酸外，还检测到全氟庚酸，全氟壬酸，全氟癸酸，全氟十一酸，以及全氟十二酸，是所含全氟化合物种类最多也是含量最高的样品。这可能与该污水处理厂所处理的污水来源有重要关系。重金属浓度及总有机碳的数据表明，全氟化合物含量高的地区，有毒金属含量也较高。
全氟辛基磺酸与生物大分子形成非共价结合产物可能是全氟辛基磺酸对生物体产生毒性效应的途径，鉴于此，本论文用电喷雾-四级杆-飞行时间串联质谱分析了水相体系中的全氟辛基磺酸与细胞色素C非共价结合产物。根据结合常数定义推导出计算公式，该方法可根据初始细胞色素C及全氟辛基磺酸浓度以及非共价结合产物与细胞色素C强度比来计算结合常数，避免了计算结合产物绝对浓度。测得的三级结合常数分别为4.487×103L mol-1，3.39×106 L2 mol-2，3.0×1013 L3 mol-3。与常规的利用Scatchard曲线来计算结合常数的方法相比节省了工作量，提高了工作效率。