亚胺还原酶的挖掘改造及在环状手性胺合成中的应用研究

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手性胺是一类重要的药物中间体,广泛存在于天然产物和药物分子中。环状手性胺兼具氮原子的生物活性和杂环化合物的特性,因此环状手性胺的合成在工业上具有重要的价值。酶法催化亚胺的不对称还原制备手性胺,因具有理论得率高、环境友好、原子经济性好等优点,近年来受到学术界和工业界的广泛关注。本论文通过基因组数据挖掘的方法,筛选获得了三个新颖的亚胺还原酶,并成功地用于高效催化3H-吲哚和二氢异喹啉等环状亚胺的不对称还原;同时利用蛋白质工程技术,对酶的结构进行改造,提高了酶的催化性能。主要研究内容如下:  第一部分,亚胺还原酶的基因挖掘。以来源于Streptomyces sp.GF3587和Streptomyces sp.GF3546的R-选择性的亚胺还原酶(RIR)和S-选择性的亚胺还原酶(SIR)的氨基酸序列为探针,从NCBI数据库中挖掘潜在的目标基因进行分子克隆,并导入大肠杆菌BL21(DE3)中进行异源表达,成功获得了15个可溶表达的蛋白。分别以2-甲基-1-吡咯啉、6-甲基-2,3,4,5-四氢吡啶、2,3,3-三甲基-3H-吲哚和1-甲基-3,4-二氢异喹啉四个化合物作为模式底物对这15个候选酶进行筛选,最终从Paenibacillus lactis中筛选获得了两个性能优良的亚胺还原酶(PlSIR和PlRIR),从Stackebrandtia nassauensis中获得了一个性能优良的亚胺还原酶SnIR,这三个酶被选择用于后续的研究。  第二部分,亚胺还原酶的酶学性质表征。对前期筛选得到的这三个性能较好的亚胺还原酶PlSIR、PlRIR和SnIR进行了纯化,获得的纯酶用于其性能表征。结果显示:PlSIR、PlRIR和SnIR的最适温度分别为40、50和50℃;最适pH分别为6.0、6.0和8.0;三者均具有较好的热稳定性,30℃下半衰期分别为347、165和64h;未发现对这三个酶有激活作用的金属离子。动力学研究,这三个酶对底物均具有较高的亲和力和催化效率,Km分别为0.48、0.26和0.056mM,催化效率kcat/Km分别为23.4、1.58和54.0s-1mM-1。  第三部分,3H-吲哚类亚胺的酶促不对称还原。研究发现:PlSIR和PlRIR对一系列的3H-吲哚和3H-吲哚碘盐都具有一定的活性,且它们对3H-吲哚碘盐的活性都明显高于对应的3H-吲哚。PlSIR能高效催化还原一系列3H-吲哚和3H-吲哚碘盐,产生高光学纯度的S型产物,分离得率高达87%,ee值高达>99%。而PlRIR催化还原3H-吲哚和3H-吲哚碘盐生成R型的仲胺和S型的叔胺,产物的ee值可达66~98%。  第四部分,四氢异喹啉衍生物的酶促合成。SnIR对一系列二氢异喹啉衍生物具有还原活力,但随着底物位阻的增大,活力逐渐降低。另外,SnIR受到多个底物的抑制,而随着底物空间位阻的增大,抑制程度也相对减弱。在实际反应中,经过简单的助溶剂浓度优化,高达100mM(15g/L)的1-甲基-3,4-二氢异喹啉在4h内无需分批补料即可实现完全转化。实现了一系列二氢异喹啉衍生物的不对称还原,包括位阻较大且具有药用价值的底物1-苯基-3,4-二氢异喹啉,表明SnIR具备催化还原大位阻环状亚胺的能力。  第五部分,SnIR酶的分子改造。针对SnIR对大位阻二氢异喹啉活性较低的问题,我们对其进行了单点饱和突变、随机突变和组合突变,获得了一些有益突变体。其中突变体M4(T123I/G228T/Q215R)的对1-甲基-3,4-二氢异喹啉的催化效率kcat/Km相比于母本提高了3.3倍。在产物1-甲基-1,2,3,4-四氢异喹啉的制备反应中,突变体M4的时空得率高达268gL-1d-1,相比于母本提高了4.2倍。此外,筛选得到了一些三突变体,对多个大位阻二氢异喹啉的比活力提升了4~56倍。构建了一个小型突变体工具箱,实现了7个大位阻四氢异喹啉的高对映选择性合成,产物的ee值高达98%~>99%。
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